chr1	941791	942135	942082	Y	HES4	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,ISG15,AGRN	ISG15,AGRN	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ISG15	4668	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr1	1005293	1005547	1005421	Y	HES4	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1060905	1061095	1061000	Y	RNF223	C1orf159	MIR429,MIR200B,MIR200A,ACAP3,SCNN1D,B3GALT6,SDF4,UBE2J2,C1orf159	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C1orf159	11164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	1063914	1064111	1063979	Y	AGRN,VWA1	C1orf159	B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1orf159	14173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	1093610	1093958	1093954	Y	ATAD3C,TMEM88B	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	43869	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	SDF4,B3GALT6,UBE2J2	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.21029753099585
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr1	1978731	1978937	1978887	Y	NADK,PRKCZ	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM52	130019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr1	3227700	3227783	3227742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	141207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	3232812	3232866	3232839	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	136124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	3237165	3237518	3237290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	131472	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	3251760	3252019	3251890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	116971	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	3325555	3326143	3325876	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	42847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	RNF207,RPL22	NA	NA	NA	NA	RNF207	41866	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	145106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	169839	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	177425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-431K24.1	361019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	387785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	376474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	8720526	8720683	8720608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	155019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	9298798	9298942	9298853	Y	NA	H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	5964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	9318130	9318195	9318182	Y	NA	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	H6PD	25296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	9486434	9486788	9486620	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	110753	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	10559059	10559458	10559098	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	28476	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	38484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	10959985	10960148	10960064	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105278	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	10997518	10997835	10997575	Y	CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	TARDBP	72579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr1	11040299	11040592	11040356	Y	NA	TARDBP	NA	NA	NA	NA	TARDBP	29822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	12509354	12509466	12509435	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166271	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	14926383	14926731	14926557	Y	KAZN	KAZN	NA	NA	NA	NA	KAZN	3183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	15266491	15266726	15266609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	210302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	15416988	15417263	15417153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	59765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	60969	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	15738661	15738986	15738829	Y	SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	4270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16401814	16401932	16401873	Y	NA	FAM131C	NA	NA	NA	NA	FAM131C	3687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16438237	16438733	16438326	Y	NA	FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2	FAM131C,CLCNKB	IMR90	Hi-C	24141950	FAM131C	40110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16439002	16439355	16439225	Y	NA	FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2	FAM131C,CLCNKB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-276H7.2	40351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	16500084	16500309	16500220	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr1	17353741	17353845	17353793	Y	NA	ATP13A2,SDHB	ATP13A2	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	17318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	PADI1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI1	10483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	12.3690875458958
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	18884159	18884499	18884233	Y	NA	RP1-8B22.1	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	46547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	19280139	19280583	19280395	Y	UBR4,IFFO2	IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	19614370	19614635	19614441	Y	ALDH4A1,AKR7A3	MRTO4,AKR7A2,PQLC2	NA	NA	NA	NA	AKR7A2	22005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	20505958	20506082	20506020	Y	RNF186,PLA2G2A,UBXN10	PLA2G2F,UBXN10,UBXN10-AS1	PLA2G2A,PLA2G2C,UBXN10,VWA5B1	IMR90	Hi-C	24141950	UBXN10	4496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	22836447	22836690	22836500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	60103	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	24722613	24722643	24722628	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	17641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	24789793	24789894	24789844	Y	NA	NIPAL3,RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	37493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	24878735	24879052	24878918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN3	51348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	25237083	25237520	25237460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC4	167235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	25237596	25238132	25237861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC4	167748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	25246815	25246921	25246868	Y	NA	NA	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	CLIC4	176967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	25357149	25357829	25357484	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	199164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	25360165	25361177	25360621	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	195816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	25425738	25426059	25426056	Y	NA	NA	RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	130934	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr1	26003805	26004144	26003975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	120523	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	26184900	26185246	26185071	Y	NA	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.30471804661337
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.45493340605565
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	27519342	27519481	27519412	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A1	27870	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	27901397	27901604	27901422	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	27338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28201800	28202156	28201857	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	RPA2	37101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28437098	28437429	28437333	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,FAM76A,EYA3,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90	Hi-C	24141950	EYA3	23891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28618110	28618271	28618191	Y	ATPIF1	SESN2,MED18	NA	NA	NA	NA	SESN2	34072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	28776524	28777127	28776532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC1	53328	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-65J11.1	52795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31320336	31320627	31320524	Y	NA	RP1-65J11.1	SDC3	K562	ChIA-PET	22265404	RP1-65J11.1	25261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	26014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	RP11-439L8.3	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	6767	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1522	22973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	33427851	33428169	33427991	Y	PHC2,RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33457406	33457727	33457615	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	35336428	35336734	35336581	Y	NA	NA	C1orf212	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GJB3	91638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	36592352	36592554	36592389	Y	NA	ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	TRAPPC3	20544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	36715455	36715834	36715645	Y	EIF2C1,EIF2C3	THRAP3	NA	NA	NA	NA	THRAP3	27438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	37195884	37196007	37195923	Y	OSCP1	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS15	267846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	39593257	39593498	39593378	Y	NA	MACF1	NA	NA	NA	NA	MACF1	48269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.9098668121113
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	136331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	140533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	42385609	42385954	42385889	Y	FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	NA	NA	NA	NA	NA	GUCA2A	242435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	43524188	43524462	43524346	Y	NA	NA	SLC2A1,FLJ32224,LOC100129924,C1orf50,LEPRE1,ERMAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A1-AS1	101468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	43533809	43534205	43534063	Y	NA	NA	FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A1-AS1	111089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	44428103	44428423	44428269	Y	SLC6A9,RNF220,IPO13	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	5249	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	45909846	45909857	45909852	Y	NA	TESK2	NA	NA	NA	NA	TESK2	45015	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	48024290	48024572	48024431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	226821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	48935854	48936015	48935919	Y	NA	SPATA6	NA	NA	NA	NA	SPATA6	9	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	623857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	186651	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	160001	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	1576	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	PHBP12	NA	NA	NA	NA	PHBP12	17715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHBP12	68010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	54715450	54715803	54715579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	51741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACOT11	51605	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-466L17.1	149677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-466L17.1	135113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	151190	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	65534177	65534450	65534358	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	RP4-535B20.1	AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-535B20.1	2757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	66815726	66816360	66815919	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	559529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	358223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	67802002	67802116	67802059	Y	MIER1,SLC35D1,IL23R,IL12RB2	NA	NA	NA	NA	NA	SERBP1	91982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	68849988	68850367	68850179	Y	NA	NA	LOC100289178,WLS,RPE65	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	110537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.42059506199169
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	73825398	73825415	73825407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	256923	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	73859450	73859778	73859467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	290975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78019403	78019530	78019478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	127574	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78171350	78171363	78171357	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	24246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr1	78567287	78567595	78567375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	124061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	80230584	80230813	80230699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	1117103	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPF1	232435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	85320078	85320332	85320201	Y	GNG5,MCOLN2,C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	165592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	89167079	89167239	89167155	Y	GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	19174	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	89739985	89740544	89740197	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	GBP5	NA	NA	NA	NA	GBP5	3441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	91361231	91361653	91361295	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	46024	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	91793812	91793887	91793849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	170521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	92013932	92014194	92014126	Y	NA	CDC7	GLMN,RPAP2,TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,BRDT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	49524	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	92189033	92189061	92189048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	180831	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	92255921	92256250	92256086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	113642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	93002551	93002867	93002761	Y	RPAP2,GLMN,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	240007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	241118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	93660433	93660767	93660600	Y	NA	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	16148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	RP5-1033H22.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1033H22.2	34130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	79662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.98283082796802
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	116701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	95263833	95264301	95264195	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	19536	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	100878516	100878703	100878610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	69932	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	108048540	108048889	108048883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	451273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	108617640	108617970	108617857	Y	FAM102B,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	123501	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	108661190	108661332	108661267	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	80139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	108870455	108870699	108870577	Y	NA	NA	SLC25A24	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A24	128984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109099158	109099479	109099238	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	1232	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109133120	109133338	109133232	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	32409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109133637	109134097	109133761	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	32926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	109788948	109789150	109789063	Y	GSTM3	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	1491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109797001	109797635	109797309	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	6360	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	MYBPHL	5511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	109850258	109850620	109850439	Y	WDR47	PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	MYBPHL	2595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	110895542	110895785	110895664	Y	NA	RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	RBM15	16414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	3494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	DRAM2	48396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	111996023	111996307	111996190	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	6025	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.6437744372907
chr1	113734243	113734639	113734494	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	NA	NA	NA	NA	NA	CSDE1	305893	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	116291091	116291334	116291215	Y	CASQ2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	108517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	71310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	116878887	116879201	116879105	Y	ATP1A1	ATP1A1	ATP1A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1A1	34089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	116918317	116918655	116918398	Y	NA	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	117017908	117018073	117017956	Y	ATP1A1	NA	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1OS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP1A1OS	58664	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	117032033	117032296	117032175	Y	ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	ATP1A1,SLC22A15,MAB21L3,ATP1A1OS,CD58	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP1A1OS	72789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	117040346	117040781	117040440	Y	ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	70880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	59740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117082797	117083071	117083005	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	28590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117610144	117610413	117610279	Y	NA	RP11-27K13.3,TTF2	VTCN1,TRIM45	IMR90	Hi-C	24141950	TTF2	9219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	117619913	117620299	117620136	Y	CD101	RP11-27K13.3,TTF2,TRIM45	NA	NA	NA	NA	TTF2	18988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	118153815	118153988	118153913	Y	FAM46C	FAM46C	NA	NA	NA	NA	FAM46C	7259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	120380695	120381105	120381020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF697	192299	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	120607153	120607333	120607254	Y	ZNF697,NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	2907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H3DP1	582407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	62344	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL9	54287	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	147189197	147189465	147189317	Y	NA	ACP6	ACP6,LOC100289211	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ACP6	48579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNU1-92P	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	150294873	150295138	150294978	Y	PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3	C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2	NA	NA	NA	NA	PRPF3	2948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	151486181	151486300	151486231	Y	SELENBP1,RORC,CGN	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	5195	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2	NA	NA	NA	NA	AL450992.2	2608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	S100A10	46182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	154151566	154151965	154151766	Y	NA	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	13159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	NA	NA	NA	NA	NA	HAX1	56150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	154717398	154717575	154717488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	118923	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	155055153	155055331	155055249	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1	NA	NA	NA	NA	EFNA3	20929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	155066604	155066635	155066620	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1	IMR90	Hi-C	24141950	EFNA1	31301	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	156133837	156133883	156133860	Y	C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	27997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	883148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	158982200	158982857	158982480	Y	AIM2,PYHIN1,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	14442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	160711095	160711588	160711244	Y	CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	151182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	162129294	162129634	162129458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	91730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	169071998	169072131	169072049	Y	C1orf114,ATP1B1	ATP1B1	NA	NA	NA	NA	ATP1B1	804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	169532682	169533387	169533357	Y	NA	F5	NA	NA	NA	NA	F5	20439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	NA	NA	NA	NA	NA	SCYL3	181180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	METTL13	83401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	172305839	172305991	172305915	Y	DNM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	105239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	175159885	175160247	175160001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	204551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	78717	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	115132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	181031700	181031837	181031769	Y	IER5	STX6,MR1,IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	23801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	183339103	183339135	183339119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	100216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	183743084	183743343	183743214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGL1	139864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	183855028	183855346	183855094	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	163465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	184700299	184700688	184700567	Y	NA	EDEM3	NA	NA	NA	NA	EDEM3	21359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	184828541	184828899	184828707	Y	IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	106494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	184836042	184836526	184836376	Y	EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	105156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	184940554	184940925	184940856	Y	NA	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	186445429	186445441	186445438	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	102539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	189173561	189173583	189173572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	2377476	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	191536543	191536778	191536610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	1146535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	110765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	TROVE2	101729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	193418722	193419025	193418873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	329575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	173581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf53	95117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.00428732772882
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	198884632	198885024	198884962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	760539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	198894891	198894966	198894922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	770798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	779842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	202214153	202214446	202214299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN7	85437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	204071387	204071653	204071532	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	31144	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	205474556	205474866	205474575	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	2833	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	206931189	206931520	206931334	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,IL10	IL10	NA	NA	NA	NA	IL10	12319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	206939730	206940044	206939954	Y	NA	IL10	NA	NA	NA	NA	IL10	3795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	207921430	207921703	207921565	Y	CR1L	CD46	CR1L	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	1699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	208267767	208267971	208267827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	147694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	209798058	209798744	209798639	Y	NA	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	25067	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	209806744	209806957	209806914	Y	G0S2,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	16854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	209827285	209827712	209827546	Y	LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	3474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	209829183	209829498	209829302	Y	IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3	LAMB3	NA	NA	NA	NA	LAMB3	5372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211423824	211424043	211423934	Y	NA	RCOR3	NA	NA	NA	NA	RCOR3	5676	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211753366	211753524	211753445	Y	TRAF5	SLC30A1	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	3282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211964831	211965131	211964981	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	36983	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	212643548	212643711	212643612	Y	NA	NENF	ATF3	K562	ChIA-PET	22265404	NENF	39319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	44106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	214163432	214163790	214163677	Y	NA	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	218648559	218648794	218648717	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	130982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	220443411	220443639	220443413	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP2	157	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	221356304	221356835	221356623	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	398203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	221955945	221956219	221956110	Y	NA	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	42427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	224019430	224020596	224019827	Y	FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	11078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	224458940	224459060	224459002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVL	57029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	224719534	224719550	224719542	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	96799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	291892	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR,RP11-496N12.6	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	225654906	225655584	225655524	Y	TMEM63A,LBR,LBR	LBR,RP11-496N12.6	NA	NA	NA	NA	RP11-496N12.6	3861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	226320775	226321123	226320910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	51308	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	226366367	226366621	226366494	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	5810	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	226896121	226896509	226896380	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	28515	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	228651177	228651630	228651444	Y	HIST3H2A,HIST3H2BB	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	RNF187	IMR90	Hi-C	24141950	HIST3H2BB	7369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	228945464	228945740	228945561	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	76640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	229163343	229163424	229163384	Y	NA	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	241351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	234752255	234752429	234752320	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	8984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr1	234881537	234881788	234881657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	101502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234891292	234891478	234891345	Y	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	111257	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	195061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	167312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235151923	235152024	235152010	Y	ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	TOMM20	138227	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47252	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	235243001	235243596	235243521	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	46655	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	236105368	236105579	236105474	Y	NA	NA	LYST,NID1,GNG4	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	60428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	237459854	237460200	237460066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	503244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.8884103123505
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	241093225	241093542	241093384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	66552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPN3	57207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	243476313	243476499	243476468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	58993	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	146838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	245162358	245162654	245162559	Y	NA	EFCAB2	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	31351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr1	245810793	245811072	245810933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	494506	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3123873	3124204	3123982	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	17348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	3528683	3528786	3528735	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	296687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr10	3850308	3850795	3850409	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	24835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3856317	3856712	3856416	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6,AKR1E2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	30844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3975714	3975890	3975762	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-433J20.1	116028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	3983198	3983475	3983337	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-433J20.1	108443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-433J20.1	191890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00704	56998	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	4775719	4776039	4775944	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00704	57373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5336164	5336286	5336241	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	116228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	78123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.8884103123505
chr10	5576341	5576485	5576413	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	123827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	124985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASB13	118368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	ASB13	117389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	ASB13	115288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5593718	5593999	5593816	Y	NET1,CALML3	NA	NET1	IMR90	Hi-C	24141950	ASB13	112559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	6013642	6013801	6013714	Y	PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	4349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	6182474	6182743	6182618	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	2138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	6342540	6342669	6342624	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	157659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	7898819	7898904	7898862	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	40352	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	7902237	7902611	7902424	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	43770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN	NA	NA	NA	NA	OPTN	3492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	190567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	172933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	503174	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	434343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	22025175	22025497	22025336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	194575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	22201596	22201935	22201928	Y	EBLN1	RN7SKP37	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	18137	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr10	22853668	22853687	22853679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	147797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	22932994	22933290	22933224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68194	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	22961361	22961802	22961720	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	39682	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	23344774	23344811	23344800	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	37624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	23701011	23701549	23701305	Y	OTUD1	OTUD1	NA	NA	NA	NA	OTUD1	24649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	24754185	24754590	24754306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	256007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr10	26789137	26789225	26789181	Y	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	195363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	27130056	27130389	27130223	Y	NA	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	17627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	29184035	29184352	29184192	Y	BAMBI	NA	LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	219764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr10	29254247	29254334	29254291	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	289976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	29845158	29845363	29845275	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	148827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	29887787	29888175	29887987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	135535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	52683	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	30736122	30736481	30736327	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	15256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	30818244	30819051	30818562	Y	MAP3K8,ZNF438	NA	MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	97378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	34922261	34922558	34922409	Y	PARD3	RP11-8L18.3	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	28471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	35258130	35258295	35258186	Y	CREM,CREM	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	95992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	35425292	35425645	35425387	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.1,RP11-162G10.5,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	42400063	42400397	42400233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	645873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	43782816	43783033	43782934	Y	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD4	82057	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	43913618	43913796	43913710	Y	CSGALNACT2,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	ZNF487P	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-517P14.2	390	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	44100382	44100859	44100681	Y	CSGALNACT2	ZNF239,CAP1P2,ZNF485	NA	NA	NA	NA	ZNF485	527	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	45072210	45072303	45072239	Y	C10orf25	NA	TMEM72-AS1,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF4	380552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	893194	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	48591812	48592143	48591972	Y	ZNF488	NA	SYT15	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	238788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	48643243	48643571	48643408	Y	NA	NA	LOC643650,SYT15,GDF2,GPRIN2,GDF10	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	290219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	49725975	49726150	49726063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	213277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	62111952	62112088	62112018	Y	ANK3,ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	424001	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	63979384	63979550	63979547	Y	NA	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	46916	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	69579652	69579872	69579788	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	16052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	71283312	71283690	71283502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	74083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	AIFM2	NA	NA	NA	NA	AIFM2	49468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	76997919	76998322	76998050	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	4131	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	81004480	81004949	81004783	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	100276	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	81956011	81956585	81956252	Y	ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	6743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	82257950	82258092	82258025	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	35606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	82260440	82261008	82260524	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	32690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	83263081	83263396	83263238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	969383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	274790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	118731	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP8	81420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP8	81917	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	90923331	90923726	90923650	Y	ANKRD22,FAS,IFIT5,IFIT3,IFIT3,IFIT2,IFIT1	NA	CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-149I23.3	117796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	95145053	95145431	95145242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	94643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	97218383	97218641	97218563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	100530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	97327639	97327692	97327665	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	8468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	98432353	98432529	98432425	Y	LCOR,PIK3AP1	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	45742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	98433072	98433822	98433312	Y	LCOR,PIK3AP1,TM9SF3	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	44449	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	98455139	98455586	98455510	Y	LCOR,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	22685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	99302907	99303185	99303057	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	HOGA1	38895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	100019738	100019959	100019849	Y	C10orf28	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	6048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	101744070	101744300	101744185	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	23376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	103539197	103539512	103539463	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	1658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	103717791	103718012	103717910	Y	C10orf76	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	95938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr10	104769429	104769711	104769602	Y	INA	NA	NT5C2	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM2	93379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.28754887458139
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	108757582	108757742	108757678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147	2646060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	111650301	111650520	111650491	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	30791	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	112051912	112052490	112052119	Y	ADD3,MXI1	SMNDC1	NA	NA	NA	NA	SMNDC1	10219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	112533972	112534336	112534061	Y	PDCD4	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	95229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	114148894	114149633	114149365	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	17118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	114940720	114940897	114940795	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	115070178	115070533	115070251	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	362169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	115440649	115440877	115440799	Y	CASP7	CASP7	NA	NA	NA	NA	CASP7	3707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	115719262	115719399	115719345	Y	NA	NA	ADRB1,NHLRC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NHLRC2	106842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	115861100	115861357	115861304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR2110	70581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	116161021	116161267	116161255	Y	NA	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	1248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	116726934	116727115	116726983	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	30982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	118154890	118154986	118154939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	729111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	120482173	120482528	120482344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3A	355788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	121031141	121031480	121031339	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	66040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	121415317	121415432	121415359	Y	GRK5,BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	6435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	121452837	121453189	121453108	Y	NA	BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	43955	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	122270774	122271036	122270905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-572P18.1	158056	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	122918665	122919069	122918920	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	RP11-159H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	27428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr10	123027203	123027438	123027321	Y	NA	NA	FGFR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-159H3.1	135966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	123197092	123197323	123197208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	158649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr10	123283349	123283529	123283438	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	72443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr10	123313040	123313152	123313149	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	42820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.5321847496412
chr10	123340054	123340398	123340080	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	15574	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr10	123418268	123418559	123418278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	62296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr10	125600253	125600511	125600402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	250695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	126213697	126214091	126213879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPP	65294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	114909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126397729	126397974	126397834	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	32864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	126406559	126407126	126406852	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	23712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.6652309370515
chr10	126410085	126410502	126410408	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	20336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126413244	126413567	126413371	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	17271	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	126421726	126422139	126421939	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	8699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126773443	126773862	126773517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	73877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126782105	126782284	126782195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	65455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	126837951	126838191	126838020	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	9548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	126840629	126841204	126840953	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	NA	NA	NA	NA	CTBP2	6535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	128351863	128352142	128352116	Y	NA	C10orf90	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf90	4937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	129704108	129704655	129704249	Y	PTPRE	CLRN3	NA	NA	NA	NA	CLRN3	14897	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr10	129721316	129721687	129721518	Y	NA	CLRN3	NA	NA	NA	NA	CLRN3	32105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr10	129787766	129788203	129788000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLRN3	98555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	131750004	131750210	131750111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	182453	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	133454610	133454819	133454663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK32C	688532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	134043390	134043516	134043464	Y	JAKMIP3	NA	NA	NA	NA	NA	STK32C	99835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	134212658	134212854	134212750	Y	NA	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	3986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	INPP5A	18146	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	15244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	1569740	1569888	1569766	Y	TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	21262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	1847921	1848122	1848046	Y	KRTAP5-3	SYT8	H19	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYT8	1212	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2484558	2484875	2484798	Y	TRPM5,KCNQ1	KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	20644	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2503550	2503862	2503623	Y	KCNQ1	KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	39636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2746958	2747301	2747029	Y	TSSC4	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	27734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2799950	2800256	2800114	Y	KCNQ1,CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	80726	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18AS	10661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	3175519	3175620	3175572	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	10349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195,TSSC2	NA	NA	NA	NA	TSSC2	43548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	4505648	4505760	4505741	Y	TRIM21,OR51G1,OR51D1,OR51T1,OR51F2,OR52K2,OR52K1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM21	92722	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	7624372	7624649	7624458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	71804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	8251033	8251182	8251107	Y	TRIM66,STK33	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3F	261235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	8632537	8632549	8632543	Y	ASCL3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	69409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	10063724	10063946	10063792	Y	SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	249808	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	10135641	10135992	10135817	Y	NA	NA	LOC283104,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	SBF2	177762	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	12065635	12065803	12065720	Y	NA	MICAL2	DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	47740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	11473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.49355907784842
chr11	14916687	14916856	14916788	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	4889	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	16121256	16121272	16121264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	511407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	17164162	17164523	17164517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C2A	63007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	19440729	19441084	19440796	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	70458	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	22362163	22362363	22362263	Y	FANCF,SLC17A6	NA	NA	NA	NA	NA	AC103801.2	282497	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	32109882	32110285	32110029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCN1	277943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	34622320	34622551	34622432	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44	IMR90	Hi-C	24141950	EHF	18089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	40350817	40351004	40350911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1206980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	45052722	45052734	45052728	Y	TSPAN18	NA	LOC221122,TP53I11,PRDM11	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	81882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr11	46385171	46385493	46385285	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	14813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	44434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	46538668	46539048	46538858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMBRA1	74627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	57333685	57333973	57333758	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	57713900	57713912	57713908	Y	UBE2L6,OR9I1,OR5B17,OR1S1,OR10Q1,OR5B3,OR5B2,OR5B12,OR1S2,OR10W1,OR9Q2,OR9Q1,OR6Q1	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND1	195185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	59894907	59895094	59895001	Y	OR10V1,STX3,MS4A13,MS4A2	NA	NA	NA	NA	NA	TCN1	262859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	60843253	60843606	60843384	Y	SLC15A3,TMEM138	CD5	CD5	IMR90	Hi-C	24141950	CD5	24261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61456345	61456647	61456520	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10440	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61467819	61468013	61467906	Y	CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	21914	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.96566165593605
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	TMEM258	6917	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61742606	61743000	61742909	Y	NA	BEST1,FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	9474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	61800988	61801486	61801080	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	67856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	75008	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	62305940	62306223	62306072	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	5248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	8867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	63350815	63351029	63350927	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	21960	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	63712623	63712721	63712672	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	8192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.6437744372907
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	CCDC88B	2861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	CCDC88B,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr11	64320859	64321220	64321040	Y	C11orf85	NA	SLC22A12,NRXN2	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA4	196239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	64631898	64632818	64632128	Y	CDC42EP2,FAU,EHD1	CDC42BPG,EHD1,MIR194-2,ATG2A	NA	NA	NA	NA	EHD1	20950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	8.96994898366487
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.38196939019892
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	67039199	67039528	67039325	Y	TBC1D10C,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	7318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	68065646	68065898	68065824	Y	CHKA,LRP5	C11orf24,LRP5	SUV420H1,C11orf24,LRP5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP5	12179	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	68099033	68099353	68099110	Y	NA	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	20956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	68147876	68148306	68148095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	69799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr11	68273880	68274272	68274031	Y	NA	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	47694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTL5	129822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEOV	137520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	195423	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	69639961	69640299	69640038	Y	NA	NA	FGF3	K562	ChIA-PET	22265404	ORAOV1	151777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr11	69655407	69655781	69655522	Y	FGF19,FGF3	NA	ANO1	IMR90	Hi-C	24141950	ORAOV1	167223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.2	69327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	69906060	69906083	69906072	Y	NA	RP11-626H12.2,ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	16325	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	70367951	70368077	70368014	Y	SHANK2	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	125357	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	70748291	70748347	70748332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHANK2	213276	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	70759663	70760245	70759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHANK2	201378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	71780398	71780482	71780403	Y	IL18BP,IL18BP	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	8900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	72348117	72348448	72348274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	154196	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	39897	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	72487947	72488068	72488008	Y	NA	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	14576	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	74171904	74172163	74171977	Y	SPCS2,RNF169,C2CD3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	4611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	74176233	74176573	74176529	Y	KCNE3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	74871497	74871764	74871689	Y	OR2AT4	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO2B1	61889	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	75060567	75060771	75060596	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	231424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	27253	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	76674520	76674873	76674698	Y	B3GNT6	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	101106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	76883031	76883248	76883107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	107052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr11	78000759	78000964	78000861	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	102891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	78376949	78377109	78377029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	93030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86381936	86382132	86382071	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86433528	86433764	86433646	Y	NA	NA	PRSS23,ME3	IMR90	Hi-C	24141950	ME3	51850	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	86841159	86841223	86841164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	94273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	89988834	89989089	89988962	Y	NA	CHORDC1,RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	24639	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENDOD1	61814	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95963875	95964372	95964111	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	109972	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	95991442	95991675	95991614	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	82669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	95994127	95994433	95994401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	79911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	96024131	96024308	96024240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	50036	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	120730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	106491098	106491425	106491260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	544606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	107986432	107986807	107986620	Y	NA	ACAT1	NA	NA	NA	NA	ACAT1	3436	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	111992719	111993046	111992953	Y	NA	C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18	NA	NA	NA	NA	SDHD	37092	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	113552333	113552865	113552581	Y	NA	TMPRSS5	NA	NA	NA	NA	TMPRSS5	22230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	113637897	113638051	113637974	Y	CLDN25	ZW10	NA	NA	NA	NA	ZW10	4482	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO2	709857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	115371607	115371956	115371778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO2	1063499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	116061103	116061309	116061204	Y	NA	NA	CADM1,FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	580395	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	AP000936.1	113719	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	116864339	116864649	116864442	Y	SIK3,PCSK7	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	40118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	116883407	116883544	116883525	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	21223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	117565853	117566051	117566030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL10RA	289012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	8.68668743681229
chr11	118786339	118786473	118786384	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	6922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	121199399	121199704	121199552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	121208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	121289334	121289764	121289479	Y	SORL1	SORL1	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	31148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	124048157	124048385	124048276	Y	OR8B12,TBRG1	NA	OR8B3	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	64088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	124638889	124639135	124639012	Y	NA	NRGN,RP11-677M14.2,VSIG2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	8703	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	128172320	128172993	128172659	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	ETS1,FLI1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	282460	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	128294765	128294892	128294836	Y	NA	NA	ETS1,FLI1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	160561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr11	128341167	128341527	128341350	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	128385518	128386026	128385881	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	69427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	128388897	128389626	128389454	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	65827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ5	168342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	133588	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	129185836	129186114	129185975	Y	NA	ARHGAP32	ARHGAP32,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP32	38617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	129201080	129201232	129201157	Y	NA	BARX2	ARHGAP32,KCNJ5,C11orf45	IMR90	Hi-C	24141950	BARX2	42603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	129730176	129730501	129730339	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	32984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	130450344	130450649	130450537	Y	NA	NA	ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	133475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	130767172	130767510	130767285	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	131934936	131935322	131935091	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP003039.3	403459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr11	133804654	133804943	133804849	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	19937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr11	133814977	133815479	133815368	Y	NCAPD3,IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	9401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr11	133825450	133825979	133825755	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NINJ2	90568	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	116999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	1717506	1717606	1717553	Y	NA	FBXL14	FBXL14,ERC1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	16175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	1778192	1778764	1778488	Y	NA	ADIPOR2	ADIPOR2,DCP1B	IMR90	Hi-C	24141950	ADIPOR2	16976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	3420231	3420354	3420293	Y	PRMT8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	101135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr12	3420784	3421182	3421090	Y	PRMT8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	101688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	NA	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543P15.1	131546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	244422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr12	3761240	3761323	3761284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	110662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	3771576	3771874	3771725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	100111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6339954	6340271	6340062	Y	VAMP1,TAPBPL,IFFO1	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	33073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6482550	6482923	6482687	Y	SCNN1A,SCNN1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	TNFRSF1A	K562	ChIA-PET	22265404	LTBR	339	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	6713710	6714101	6713905	Y	PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	7040569	7040832	7040702	Y	NA	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	8943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	7736832	7737158	7736952	Y	PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	106339	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	11755379	11755464	11755421	Y	NA	ETV6	ETV6	IMR90	Hi-C	24141950	ETV6	45324	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	11838255	11838510	11838381	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	37467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	11926847	11927297	11927011	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	126059	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	190499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12016846	12017194	12017120	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	183584	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL2L14	14819	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	12504083	12504386	12504252	Y	BCL2L14,MANSC1	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	MANSC1	2608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr12	12602381	12602995	12602706	Y	BCL2L14,DUSP16	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	94368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	3838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	13347729	13348002	13347866	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	79	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	14112244	14112326	14112257	Y	GRIN2B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134N1.2	255198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	14426966	14427222	14427069	Y	PLBD1,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134N1.2	59442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	14549073	14549306	14549114	Y	WBP11,ATF7IP	ATF7IP	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	32463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	14711449	14711733	14711518	Y	PLBD1	RP11-695J4.2,PLBD1	NA	NA	NA	NA	RP11-695J4.2	6951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	15782024	15782386	15782102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	250877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	18905579	18905804	18905692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	374844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	38.0514677938625
chr12	21039353	21039668	21039511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	548881	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	21059259	21059529	21059394	Y	SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	529020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	21162401	21162431	21162416	Y	SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	426118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	21428924	21429039	21428982	Y	SLCO1B3,SLCO1B1,SLCO1A2,KCNJ8,GYS2,SLCO1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	159510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	24877716	24878227	24878030	Y	BCAT1	NA	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-662I13.1	240211	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662I13.1	55422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	25446560	25446839	25446726	Y	NA	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	44690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	28814319	28814559	28814439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	717563	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	29581721	29581917	29581813	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	49599	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	45033	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	31789524	31789538	31789533	Y	NA	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B,METTL20	IMR90	Hi-C	24141950	METTL20	8556	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.81544629649377
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	31909925	31910440	31910295	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	29817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	32842101	32842415	32842258	Y	NA	DNM1L	NA	NA	NA	NA	DNM1L	11967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	33149945	33150082	33150013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKP2	102171	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	33741113	33741380	33741221	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ALG10	431836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	40457263	40457286	40457275	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	3106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46571353	46571525	46571439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	90275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	46608402	46609191	46609043	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	52609	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46902978	46903383	46903115	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-96H19.1	127516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	47066053	47066292	47066182	Y	SLC38A2	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	290591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	49203713	49203966	49203840	Y	NA	ADCY6,CACNB3,DDX23	NA	NA	NA	NA	CACNB3	1611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1C	47759	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	50286298	50286441	50286370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCDIN3D	51386	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	AQP5,RP11-469H8.6	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AQP5	13874	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	50936330	50936621	50936410	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	39562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	51014249	51014685	51014387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2B	117481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	51786511	51786834	51786676	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	1860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	3143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	52291135	52291309	52291180	Y	ACVRL1,ACVRL1	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	52142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.58797959346595
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	NA	KRT7	50351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	52835077	52835369	52835228	Y	NA	KRT6B,KRT6C,KRT6A	KRT75	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT6B	8541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT4	55138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53264136	53264576	53264217	Y	PFDN5	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT4	57801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT4	66934	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53795240	53795255	53795248	Y	ATP5G2,ATF7	SP1,PRR13,PCBP2	NA	NA	NA	NA	SP1	23280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC12,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	54433983	54434162	54434078	Y	NA	HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	9346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	2387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RDH5,RP11-644F5.11,CD63	NA	NA	NA	NA	CD63	10578	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RDH5,RP11-644F5.11,CD63	NA	NA	NA	NA	CD63	26060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	56690284	56690436	56690361	Y	NA	ANKRD52,COQ10A,RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A	NA	NA	NA	NA	RP11-977G19.11	1490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.57081042143397
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	58094555	58094631	58094593	Y	NA	OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2	NA	NA	NA	NA	OS9	8817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	AVIL	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	62685666	62685938	62685802	Y	C12orf61,MON2,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	14735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	63096065	63096306	63096205	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf61	100851	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	65926688	65927190	65926918	Y	NA	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	HMGA2	288721	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	66012877	66013074	66012996	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	HMGA2	202837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	289443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	68752517	68752875	68752786	Y	NA	MDM1	RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	28356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	68758255	68758343	68758299	Y	NA	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34094	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr12	69462130	69462730	69462407	Y	RAP1B,LYZ,CPM	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPSF6	168587	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	70633612	70633702	70633681	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	1072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	70648828	70649035	70648891	Y	RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	13688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	70951536	70951916	70951606	Y	KCNMB4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	91676	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	72236663	72237026	72236820	Y	NA	TBC1D15	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	5176	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	72700873	72701321	72700945	Y	TPH2	TRHDE-AS1	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	34186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	75986624	75986957	75986791	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	83208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76026406	76026738	76026572	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	122990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76060831	76060974	76060901	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	157415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76093732	76093874	76093819	Y	NA	NA	NAP1L1,OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	190316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76116548	76116691	76116626	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	213132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76153718	76154163	76153855	Y	NA	NA	PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	221632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76209246	76209451	76209339	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-114H23.1	166344	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76283192	76283327	76283260	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	92468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	27634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	76353921	76354019	76353970	Y	NA	RP11-114H23.1	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	21776	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	RP11-114H23.1,PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr12	82083633	82083892	82083721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	666692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	89038835	89039086	89038961	Y	NA	NA	LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	KITLG	66207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	89619217	89620117	89619718	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	DUSP6,LOC728084,POC1B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP6	124931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	89632867	89633143	89633005	Y	NA	NA	POC1B,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	111905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	90065189	90065567	90065562	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	35510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	90354567	90354976	90354683	Y	POC1B,ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	253490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92271670	92272050	92271828	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	262640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92415461	92415779	92415694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	118911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92446330	92446640	92446498	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	88050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	33482	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	5772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92836682	92836892	92836798	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	299009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	92955380	92955568	92955421	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	365539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	93043351	93043536	93043441	Y	EEA1,CLLU1OS	NA	EPYC,C12orf12,KERA,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	277571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	93410863	93410965	93410914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	64486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	93770329	93770575	93770474	Y	NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	94827148	94827488	94827330	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	10403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	96752607	96752772	96752695	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	39566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	97962496	97962841	97962674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	663495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	100970454	100970954	100970686	Y	NA	GAS2L3	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr12	102250819	102251404	102251014	Y	DRAM1	GNPTAB,DRAM1	GNPTAB,DRAM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DRAM1	17725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	103359249	103359470	103359411	Y	NA	PAH	NA	NA	NA	NA	PAH	9061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	104193580	104193857	104193839	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	39118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	104225376	104225573	104225475	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	7402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	104244914	104245088	104245001	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	11939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	14174	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	36793	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	107396424	107396642	107396547	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	17480	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	109037814	109037911	109037861	Y	SSH1,SELPLG	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	12079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	110260802	110261197	110261051	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	NA	NA	NA	NA	NA	FAM222A-AS1	51489	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	110517549	110517856	110517740	Y	GIT2,RAD9B,C12orf76	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	8058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	111866764	111867021	111866784	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	25012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	111883923	111883990	111883957	Y	NA	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	42171	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	112920682	112921011	112920993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	66040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	113574868	113575216	113574905	Y	NA	RASAL1,CCDC42B,DDX54	NA	NA	NA	NA	RASAL1	2824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	113579863	113580302	113580091	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1	RASAL1,CCDC42B,DDX54	NA	NA	NA	NA	CCDC42B	5361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	113580533	113580764	113580647	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1	RASAL1,CCDC42B,DDX54	NA	NA	NA	NA	CCDC42B	4899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	113741046	113741165	113741159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLBD2	53206	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	117255942	117256291	117256058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNFT2	81846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	118605193	118605499	118605376	Y	NA	PEBP1,VSIG10	NA	NA	NA	NA	VSIG10	33362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	121471797	121472025	121471886	Y	P2RX4,CAMKK2,OASL	C12orf43,OASL	NA	NA	NA	NA	OASL	3020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	121533843	121533975	121533917	Y	NA	NA	ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	OASL	58798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.5321847496412
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	124511422	124511512	124511486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	55634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	226810	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	111539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	124985154	124985447	124985301	Y	DHX37	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	64688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr12	125066562	125066782	125066660	Y	FAM101A	NCOR2	NCOR2,SCARB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NCOR2	16427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr12	125073637	125073873	125073849	Y	UBC	NCOR2	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	23502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	60743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	67760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125160747	125161145	125161022	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	110612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	119447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125201534	125201787	125201608	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	151399	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	154666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125221717	125221873	125221796	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	143341	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	125225235	125225448	125225342	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCARB1	139766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	125577703	125578001	125577737	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	29778	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	127721490	127721936	127721873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	72818	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	127910118	127910304	127910194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-351O2.2	196394	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr12	129296403	129296565	129296505	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	9963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	129301742	129302776	129302427	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	3752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	130570935	130571227	130570972	Y	RIMBP2	RP11-474D1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-474D1.2	18065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	130604079	130604318	130604215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-474D1.2	51209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr12	130610556	130610854	130610701	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-474D1.2	57686	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	PIWIL1	4241	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.13733351513912
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAN	348564	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK1	83375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	132663524	132663727	132663659	Y	SFSWAP,EP400,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	RP13-977J11.2	8513	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159879	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159436	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	133005224	133005492	133005298	Y	NA	NA	P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1	IMR90	Hi-C	24141950	FBRSL1	58645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	33720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	20694627	20695029	20694906	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	70008	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	20993930	20994321	20994126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	103675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	22000564	22000681	22000573	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	30828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	22249294	22249707	22249608	Y	FGF9	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	5772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr13	22249979	22250230	22250030	Y	NA	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	6457	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	NA	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SACS	125681	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	NA	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SACS	127281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	171566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	24701250	24701640	24701393	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	239692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr13	24835829	24835982	24835890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	248966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	24854044	24854200	24854080	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	230748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE2P1	150729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	8.59226692119477
chr13	25856268	25856641	25856378	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	3506	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	27706563	27707017	27706898	Y	NA	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	37016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	28530575	28530960	28530888	Y	CDX2	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	12316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	8098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	2665	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	21756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	31619955	31620221	31620066	Y	ALOX5AP	NA	TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HSPH1	114304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	194618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	34216569	34217156	34216982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	173030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	36630888	36631287	36631099	Y	DCLK1	NA	NA	NA	NA	NA	RFXAP	760074	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	40690248	40690533	40690364	Y	NA	NA	FOXO1	IMR90	Hi-C	24141950	COG6	462484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	42162855	42163294	42163201	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	279514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	42219317	42219744	42219583	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	335976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	42280247	42280717	42280439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	396906	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	42397573	42397928	42397750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	446361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	42967379	42967658	42967522	Y	TNFSF11,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	123090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	68254	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	302350	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	44875300	44875802	44875641	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	273481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	263902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	261884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	170685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr13	45030393	45030697	45030548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	118586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	46869807	46870189	46870040	Y	ZC3H13,LCP1,C13orf18	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	85801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	48636284	48636323	48636312	Y	NA	NUDT15,SUCLA2,MED4	NA	NA	NA	NA	SUCLA2	26159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49433672	49433840	49433729	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	90408	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49615947	49616340	49616144	Y	SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	67899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49639247	49639597	49639439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	91199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	50216185	50216584	50216280	Y	CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	47027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	51034237	51034585	51034411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	100338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	51243019	51243169	51243094	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	238645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	51464273	51464487	51464380	Y	NA	RNASEH2B,RNASEH2B-AS1	DLEU2,GUCY1B2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	17327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	550263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	60723538	60723946	60723707	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	12175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	63626096	63626398	63626247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	1021746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P110	855761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	73742042	73742346	73742194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P1	68919	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	73909414	73909609	73909563	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5P1	236291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	73985614	73985783	73985667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P1	312491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr13	74002389	74002533	74002463	Y	KLF5	NA	KLF5,PIBF1,KLF12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP5P1	329266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	74864558	74864878	74864747	Y	KLF12	NA	KLF12	IMR90	Hi-C	24141950	KLF12	158164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD6	321017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	77166796	77167041	77166918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	387010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	77881758	77881859	77881809	Y	SLAIN1	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	17326	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	77899332	77899971	77899636	Y	KCTD12,FBXL3,MYCBP2	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	147	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	78158324	78158538	78158433	Y	MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB	NA	NA	NA	NA	NA	SCEL	50515	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	80030193	80030565	80030379	Y	NA	NDFIP2	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	22722	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	SLITRK1	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	26122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.58797959346595
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3738734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3652671	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3613188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	90568619	90568996	90568823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1429078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	96424038	96424083	96424061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	96645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	98924976	98925080	98925019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	132160	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99121203	99121258	99121231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	106936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	99123285	99123381	99123333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	104813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr13	99302784	99302934	99302858	Y	SLC15A1	CALM2P4	FARP1,STK24,SLC15A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALM2P4	11291	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99628165	99628894	99628676	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	107985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99629306	99629403	99629355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	107476	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	99956842	99956954	99956899	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	90830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	99991522	99991909	99991574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	125510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	100309334	100309540	100309393	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	52415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	100644149	100644384	100644267	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	PCCA	94885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	249331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	101392317	101392331	101392324	Y	NA	NA	NALCN,A2LD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC4	66970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	102403781	102404089	102404035	Y	NALCN	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	336938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	104663923	104664083	104664030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	1168729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	273639	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	107001723	107002064	107002003	Y	NA	LINC00460	NA	NA	NA	NA	LINC00460	24847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	107026666	107026873	107026771	Y	NA	LINC00460	NA	NA	NA	NA	LINC00460	38	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr13	107070030	107070366	107070265	Y	NA	LINC00460	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	43119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	109806235	109806377	109806339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	937508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	938780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	109847392	109847697	109847628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	978665	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD13	1040567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD13	1053077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	NA	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	852447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	110521819	110522258	110522077	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	689822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	110631754	110631774	110631764	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	580306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	547233	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	464738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr13	111180820	111181023	111180903	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	31057	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	111212014	111212166	111212090	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	COL4A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	111597919	111598063	111597990	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	32503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	111616634	111616920	111616701	Y	NA	NA	LINC00346,ING1,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD10	51218	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr13	111623981	111624100	111624039	Y	ING1,C13orf16	NA	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	58565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	111633427	111633785	111633577	Y	NA	NA	ARHGEF7,LINC00346,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	68011	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113549464	113549664	113549543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	71474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113597069	113597276	113597160	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7	5C,Hi-C,ChIA-PET	22955621,24141950,22265404	MCF2L-AS1	23862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113627190	113627495	113627343	Y	NA	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	6052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr13	113650051	113650400	113650313	Y	MCF2L	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	28913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr13	113660175	113660436	113660306	Y	NA	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	39037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	113661985	113662203	113662095	Y	NA	MCF2L-AS1	F10,F7	IMR90	Hi-C	24141950	MCF2L-AS1	40847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	80.3518587905137
chr13	113704045	113704450	113704091	Y	MCF2L,DCUN1D2	NA	NA	NA	NA	NA	F10	70678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr13	114459608	114459701	114459670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6-AS1	56902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr13	114557275	114557469	114557370	Y	GAS6	GAS6-AS1,GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	7577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6-AS1,GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114740287	114740680	114740494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	155406	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114890433	114890784	114890662	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	5302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr13	114995132	114995533	114995333	Y	NA	CDC16,UPF3A	NA	NA	NA	NA	CDC16	2829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC7A7	2462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS2	66439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	25580202	25580566	25580328	Y	STXBP6	NA	STXBP6	IMR90	Hi-C	24141950	STXBP6	62699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	28061472	28061526	28061498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	895590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	31408112	31408404	31408271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	83908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	33171876	33172196	33172044	Y	AKAP6,NPAS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	219870	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	33990717	33990733	33990726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	938829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	34261027	34261291	34261159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	668271	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	37134370	37134658	37134514	Y	NA	PAX9	NA	NA	NA	NA	PAX9	9597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	38052956	38053419	38053189	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	9633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr14	38542945	38543074	38543011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXA1	475700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	MIA2,CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	45607485	45607866	45607681	Y	NA	FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FANCM	4342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	118040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K5	111084	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	54444458	54444658	54444588	Y	NA	BMP4	BMP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	BMP4	20979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	54573774	54574066	54573953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	150295	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	54603712	54603948	54603796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP4	180233	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	54902274	54902529	54902415	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	40707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	55565052	55565329	55565247	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	MAPK1IP1L,LGALS3	LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	23499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr14	55770530	55770967	55770803	Y	GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	33737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	56312825	56313142	56312958	Y	NA	NA	PELI2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00520	51419	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	59002332	59002438	59002384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	110000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	59556321	59556627	59556473	Y	NA	NA	DACT1,KIAA0586	IMR90	Hi-C	24141950	DAAM1	96737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	61571196	61571403	61571326	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	125120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	61803783	61804036	61803882	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	57225	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	61979288	61979588	61979394	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	55670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	61985151	61985397	61985317	Y	HIF1A	RP11-47I22.3	NA	NA	NA	NA	RP11-47I22.3	49861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB1,ZBTB25,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	65601506	65601634	65601523	Y	NA	MAX	FUT8,LOC645431	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	34093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.49355907784842
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	CTD-2509G16.5	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.5	36505	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	68005927	68006205	68006064	Y	MPP5,TMEM229B,PLEKHH1	PLEKHH1,TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	7471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	68943032	68943562	68943135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	56119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	68973571	68973743	68973640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	86658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	78448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69065409	69066172	69065453	Y	ZFP36L1	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	26990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr14	69216365	69216576	69216463	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFP36L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	44614	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69402735	69403079	69402843	Y	GALNTL1	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	41078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69472543	69472713	69472613	Y	NA	ACTN1	DCAF5,ACTN1	IMR90	Hi-C	24141950	ACTN1	28386	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	256275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	70465984	70466470	70466191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	274367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	1119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	72438276	72438928	72438440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	651745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	1532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	74228325	74228451	74228378	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	4875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	77473789	77473986	77473849	Y	NA	RP11-7F17.1,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	19048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	77508586	77508871	77508699	Y	IRF2BPL	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	15552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	81019191	81019257	81019224	Y	DIO2,CEP128	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	404604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	91127365	91127751	91127558	Y	RPS6KA5,CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	266519	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	91791698	91791809	91791759	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	90379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	91880070	91880210	91880118	Y	TC2N,RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	1978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	92297060	92297402	92297266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	207838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	92451454	92451633	92451538	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	53607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	93738394	93738720	93738557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	58718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	94437435	94437683	94437529	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	OTUB2	52992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	94851152	94851609	94851362	Y	SERPINA1	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	3421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	95354502	95354744	95354634	Y	CLMN	NA	CLMN,GSC	IMR90	Hi-C	24141950	DICER1	267603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	RP11-1070N10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.3	33663	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDKRB2	70414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	98086982	98087081	98087062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	825341	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	99073187	99073437	99073313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	662424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr14	99706771	99707240	99707068	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	28621	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	99726837	99727734	99727584	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	8127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	99732028	99732250	99732198	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	91505	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.58797959346595
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	100550040	100550358	100550278	Y	YY1,EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	74142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100687969	100688087	100687996	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	YY1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	YY1	14548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	100807709	100808060	100808026	Y	WDR25,WDR25,WARS,WARS	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	22905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	42745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	103307	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	107508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	403164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	102001660	102001854	102001726	Y	PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1029J19.5	193591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	18657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102193066	102193341	102193142	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	RP11-1029J19.5	2104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.70385660884427
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102662808	102663069	102662945	Y	TECPR2,HSP90AA1,WDR20	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA1	58772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	103251609	103251698	103251662	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	9796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	70050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr14	105440243	105440515	105440379	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2179	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	GPR132	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR132	28142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	105630127	105630455	105630291	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	2706	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1298739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1299302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	20858746	20859095	20858885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	1972300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	925265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	85.5449871494776
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	26104619	26105255	26104951	Y	UBE3A,ATP10A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	422491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1650875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	30240816	30241083	30240944	Y	NA	TJP1	TJP1	IMR90	Hi-C	24141950	TJP1	17985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	FAN1	NA	NA	NA	NA	FAN1	21727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	31757580	31757887	31757714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	140522	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	33132037	33132132	33132085	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	226692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	33134248	33134560	33134512	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	228903	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	588777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	34277588	34277641	34277608	Y	C15orf55	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	51736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	92393	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	214263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	37403099	37403474	37403147	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	LOC100507466,C15orf41,MEIS2	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS2	11595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	38345293	38345611	38345599	Y	NA	NA	SPRED1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED1	196916	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	506216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	576515	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	591554	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	39527316	39527429	39527373	Y	NA	NA	C15orf54	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	671540	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39578047	39578317	39578140	Y	THBS1	NA	C15orf53,THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	646030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39637466	39637772	39637619	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	586575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39657352	39657591	39657529	Y	THBS1,C15orf54	NA	THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF2AK4	566756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39668694	39669075	39668948	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	555272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr15	39673743	39674138	39673898	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	550209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	539863	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39689205	39689637	39689475	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	534710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39696909	39697463	39697288	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF2AK4	526884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	521855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	39706539	39706707	39706617	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	517640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	39915821	39916161	39915910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2AK4	308186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	40365860	40366125	40365905	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	32968	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	41788010	41788393	41788374	Y	NA	ITPKA,LTK,RPAP1	NA	NA	NA	NA	ITPKA	4419	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr15	42213328	42213713	42213448	Y	NA	SPTBN5,EHD4	NA	NA	NA	NA	SPTBN5	29053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	SPTBN5,EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	SPTBN5,EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	44289112	44289501	44289307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	122670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	44319631	44319819	44319725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	153189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	44901910	44902120	44902015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPG11	51756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	45381898	45382257	45382108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORD	68596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	45933530	45934014	45933606	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	12184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	NA	NA	NA	NA	NA	CEP152	116486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	49268018	49268116	49268067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2L	68644	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	49801788	49802033	49801795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	109144	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	50345341	50345603	50345432	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	126790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	50890405	50890451	50890426	Y	USP8,SPPL2A,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	86561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	51358266	51358334	51358300	Y	GLDN	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	159397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	51608963	51609320	51609267	Y	CYP19A1	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	410094	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	52587042	52587046	52587044	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	1047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	53063704	53063805	53063755	Y	NA	ONECUT1,RP11-209K10.2	NA	NA	NA	NA	ONECUT1	17468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-209K10.2	847715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RFX7	200514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	57465140	57465369	57465208	Y	ZNF280D,TCF12	NA	LOC283663	IMR90	Hi-C	24141950	TCF12	256319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	57857567	57857833	57857701	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	24273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	57946197	57946519	57946360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	63966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	58732356	58732646	58732550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	307531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59138361	59138756	59138559	Y	NA	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	16618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59194300	59194605	59194559	Y	NA	RNF111,SLTM	NA	NA	NA	NA	SLTM	29247	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59566542	59566544	59566543	Y	MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	96348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	59698541	59698940	59698702	Y	FAM81A	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	MYO1E,LDHAL6B,FAM81A,CCNB2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356M20.1	188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	60547541	60548010	60547775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2	145072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2,RP11-745A24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-745A24.2	5946	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	61459603	61459724	61459664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	59794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	62499952	62500233	62500097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	149280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	24.7381750917915
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	62906049	62906061	62906055	Y	NA	NA	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	225324	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr15	67409139	67409556	67409296	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	55038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	67533518	67533775	67533647	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	11363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALML4	54729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	70047760	70048370	70048206	Y	TLE3	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	304637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	70436319	70436687	70436503	Y	NA	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	47804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	70787270	70787553	70787302	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	266379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	70797214	70797333	70797235	Y	TLE3	NA	TLE3,KIF23,RPLP1	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	256599	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	71176892	71177111	71177002	Y	NA	LRRC49,THAP10	NA	NA	NA	NA	THAP10	6013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	71473372	71473722	71473547	Y	LRRC49,LRRC49,THSD4	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	290248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	71840441	71840454	71840446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	564145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	71896302	71896636	71896469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	507963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	72666496	72666825	72666661	Y	NA	RP11-106M3.1	NA	NA	NA	NA	HEXA	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	57821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	74956295	74956530	74956466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	59421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75073348	75073866	75073498	Y	ARID3B,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CYP1A2,CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75406798	75406983	75406894	Y	SIN3A,SIN3A,CLK3,CSK,C15orf39	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf39	79001	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75495544	75495835	75495599	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39	C15orf39	NA	NA	NA	NA	C15orf39	9560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75939210	75939595	75939262	Y	NA	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	76455838	76456047	76455943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG4	105702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA	NA	NA	NA	NA	ETFA	37307	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	76901664	76901845	76901842	Y	SCAPER	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	293940	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	78598854	78599004	78598959	Y	NA	DNAJA4,WDR61	WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR61	8718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	79289232	79289594	79289505	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	49316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	80149264	80149318	80149291	Y	ST20,ST20-MTHFS,ST20,MTHFS,MTHFS	MTHFS	NA	NA	NA	NA	MTHFS	38403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	80164886	80165472	80165199	Y	ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS,MTHFS,MTHFS	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	MTHFS	22249	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	80931217	80931542	80931410	Y	MESDC1	NA	FAM108C1,ARNT2,KIAA1199	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1199	138142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	55499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	81131497	81131895	81131781	Y	IL16	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	61813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	81197356	81197718	81197537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	82501	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	83376680	83377056	83376874	Y	NA	RP11-752G15.4,RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.4	17570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	83733499	83733939	83733822	Y	WHAMM	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	85290443	85290837	85290532	Y	PDE8A,ZNF592	SEC11A,ZNF592	NA	NA	NA	NA	ZNF592	577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	85951204	85951442	85951357	Y	AKAP13,PDE8A,AKAP13	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	29402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	99055	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	189716	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	86165783	86166027	86165915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	170234	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	86337060	86337529	86337372	Y	NA	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	88633664	88633865	88633769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL46	374785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	89152639	89152930	89152746	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	9597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	89638395	89638800	89638498	Y	ISG20,HAPLN3,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	9705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	89648424	89648609	89648517	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	19734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	90456787	90457058	90456927	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	C15orf38	2599	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90517862	90518059	90517946	Y	AP3S2,SEMA4B,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	WDR93,ZNF710,IDH2,MESP1,C15orf38-AP3S2,CIB1,C15orf58,SEMA4B	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF710	24565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	90945502	90945781	90945680	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	16052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	92102399	92102560	92102448	Y	SV2B,SV2B	NA	NA	NA	NA	NA	VPS33B	538566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	ASB9P1,FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	33516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr15	93592081	93592145	93592113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	167555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	440355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	94739822	94739990	94739899	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	32777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	21742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	26018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr15	99214674	99215061	99214732	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	24474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99295015	99295222	99295065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	104815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99358585	99358846	99358731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	168385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	176253	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99401021	99401241	99401076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	210821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	225836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99450086	99450215	99450157	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	259886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99864304	99864757	99864539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	68467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	99965380	99965718	99965580	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,MEF2A,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	49652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	100209243	100209470	100209289	Y	NA	NA	LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	LYSMD4	62296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	100782475	100782658	100782574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	97552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	101261253	101261648	101261594	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	119818	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	377235	377950	377755	Y	SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	22723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	809662	809847	809755	Y	MSLN,MSLN,MSLN	METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	MSLN	900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	GNG13	10100	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.13733351513912
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220322	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	1341001	1341384	1341186	Y	CACNA1H,BAIAP3	UBE2I	UBE2I,UNKL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2I	12164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,GNPTG	NA	NA	NA	NA	GNPTG	17732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr16	2175102	2175363	2175212	Y	NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2	SNORD60,TRAF7	NA	NA	NA	NA	SNORD60	27743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21,ZG16B	NA	NA	NA	NA	PRSS21	19116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	ZG16B	7591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	CLDN9	4293	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	9221431	9221974	9221622	Y	USP7,C16orf72	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	37926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	9237080	9237205	9237143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	53575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	9277609	9277994	9277792	Y	NA	NA	ATF7IP2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf72	94104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	10922717	10923252	10923012	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	45803	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr16	10956294	10956664	10956435	Y	NUBP1,CIITA	CIITA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	CIITA	12391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	10962462	10962962	10962665	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	6093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	11058771	11058999	11058871	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	22426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11198828	11199160	11198954	Y	LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	142316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11299930	11300255	11300088	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A,RMI2,SNN,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	RMI2	41221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	11326911	11327269	11327154	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	RMI2	14207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	11946483	11946539	11946512	Y	NA	RSL1D1	NA	NA	NA	NA	RSL1D1	3041	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	63250	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.8884103123505
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	20910017	20910139	20910077	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	21656930	21657029	21656972	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	NA	NA	NA	NA	NA	METTL9	50391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	22406960	22407340	22407096	Y	NA	CDR2,RRN3P3	POLR3E,CDR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDR2	39146	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	13392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	24077587	24077959	24077773	Y	PRKCB	NA	NA	NA	NA	NA	ERN2	354766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	25049848	25050165	25050010	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	24861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	29304451	29304624	29304528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P2	220288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	47281592	47281819	47281707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKB	211215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	49056369	49056621	49056485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	404310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	49892592	49892787	49892690	Y	ZNF423	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	205065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	50280304	50280568	50280347	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	2256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	50287533	50287795	50287656	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	9485	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	50372340	50372413	50372379	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	28432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	50424981	50425490	50425226	Y	NKD1	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24136	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	50573093	50573439	50573278	Y	BRD7,NKD1	NA	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	BRD7	172248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr16	51591552	51591916	51591734	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	85751	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	52526808	52526987	52526898	Y	TOX3,TOX3	NA	NA	NA	NA	NA	TOX3	52727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	53465709	53465843	53465769	Y	NA	RBL2	NA	NA	NA	NA	RBL2	46	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	55052989	55053317	55053111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX5	90215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	55535734	55536073	55535896	Y	NA	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	4837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	56458239	56458402	56458321	Y	NA	AMFR,OGFOD1,NUDT21	NA	NA	NA	NA	AMFR	789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	12303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	58299498	58299672	58299601	Y	NA	CCDC113,GINS3	NA	NA	NA	NA	GINS3	27312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	68340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	66555983	66556387	66556198	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	28060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	67993555	67993691	67993621	Y	NA	PSMB10,SLC12A4	NA	NA	NA	NA	SLC12A4	7813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	53949	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	9.91415413984012
chr16	68804487	68804868	68804749	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	35359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2,SNORD71	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	72751239	72751276	72751266	Y	NA	NA	HP,HPR	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	340321	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	72972740	72973001	72972925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	118596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	73012151	73012443	73012287	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	79154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	73079348	73079373	73079361	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	12224	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	74356396	74356719	74356558	Y	NA	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	27723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	74970861	74971182	74971035	Y	MLKL	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	59746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	78090271	78090541	78090406	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	40769	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	776970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	79692252	79692530	79692298	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	1345573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr16	80388478	80388826	80388652	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	649277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	459695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	84393830	84394115	84393945	Y	OSGIN1,CRISPLD2,COTL1	ATP2C2	ATP2C2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2C2	6018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	84641438	84641605	84641502	Y	ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	8078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	85028506	85028759	85028547	Y	COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	14382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr16	85418434	85418651	85418593	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	303028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	85558951	85559083	85559056	Y	KIAA0513,IRF8	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	162596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	85569816	85569916	85569832	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	151763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	85617282	85617663	85617577	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	104016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	19787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	85995905	85996102	85996008	Y	NA	NA	IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1,FLJ30679,FOXC2,LOC400550	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	65496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86541340	86541581	86541457	Y	FOXF1	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	45260	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86653031	86653193	86653112	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	66190	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	86664163	86664323	86664252	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	77322	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.3991385622309
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111803	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	188280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	378017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	87870717	87871153	87871035	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	29941	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	88555955	88556054	88556005	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	38230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	88700249	88701257	88700631	Y	ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA	IL17C,CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	IL17C	1742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	IL17C,CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	IL17C	1336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	88968900	88968980	88968940	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	47522	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	12308	12676	12492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	221369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	942821	943085	942871	Y	MYO1C	TIMM22	NA	NA	NA	NA	TIMM22	44464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAE	129864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	1667462	1668045	1667797	Y	PITPNA,SLC43A2,WDR81,WDR81	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	4209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr17	1992717	1993096	1992933	Y	SLC43A2,SCARF1,WDR81	OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	49390	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2082960	2083277	2083133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	121400	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2612424	2612524	2612493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	65826	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2751152	2751369	2751257	Y	PAFAH1B1,RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	72802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	2757819	2758227	2758154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	79469	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	117610	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	3534813	3534835	3534825	Y	OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2	SHPK,CTNS,TAX1BP3	TRPV1	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	2781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85	NA	NA	NA	NA	C17orf85	44267	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr17	4404427	4404640	4404582	Y	SPNS3,SPNS2	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	4294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	4412786	4412979	4412855	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A,GGT6	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	4430442	4430571	4430507	Y	ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2	SPNS2,MYBBP1A,GGT6	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	26355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	6655808	6656203	6655969	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	XAF1	XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1	IMR90	Hi-C	24141950	XAF1	563	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	6656419	6656747	6656461	Y	RNASEK,GABARAP,XAF1	XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	19	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	6660646	6660876	6660666	Y	NA	XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	3880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	6829755	6829811	6829784	Y	NA	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12P2	74575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	6851869	6852198	6852047	Y	XAF1,GABARAP,RNASEK	NA	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	61470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.8884103123505
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	233065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	320985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	15368147	15368483	15368202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	106850	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	16419408	16419751	16419580	Y	NA	FAM211A	FAM211A,CENPV,UBB,TRPV2,C17orf76-AS1,ZNF287	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211A	25941	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	AC005822.1	NA	NA	NA	NA	AC005822.1	31407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	19627830	19628049	19627942	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	22207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	19768399	19768627	19768511	Y	MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP10	111029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	21272298	21272502	21272399	Y	KCNJ18	NA	C17orf51,KCNJ12	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K3	86314	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	22069559	22069863	22069667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	593837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.79827712446179
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	182.609277204293
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.36051289043812
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	26870881	26871048	26870951	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC	NA	NA	NA	NA	UNC119	6638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RPL23A,SNORD42B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	28166109	28166223	28166182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSH2	89071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	28672650	28672985	28672901	Y	NSRP1,CPD,CPD	CPD	NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPD	30938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	29115484	29115559	29115508	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	34235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	29641803	29641965	29641879	Y	ADAP2,EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	74677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	29759240	29759393	29759318	Y	NA	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	42598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	29909272	29909544	29909457	Y	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	192630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	30907001	30907345	30907172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	95364	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	31062983	31063086	31063034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	139109	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	31159026	31159151	31159124	Y	NA	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	43044	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	32546346	32546705	32546474	Y	NA	NA	CCL2,CCL8,CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	739844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	33179831	33179955	33179851	Y	NA	NA	SLC35G3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	106594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	40323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36101828	36102076	36101951	Y	DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	1130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	36758537	36758835	36758687	Y	NA	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	1348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	37862068	37862252	37862166	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2	ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	PGAP3	11018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	37926668	37927007	37926744	Y	FBXL20,CDK12,ERBB2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	34488	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	38488015	38488253	38488146	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	24571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38502716	38503032	38502793	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	39272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	38771553	38771985	38771688	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	30775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT13	6606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	40215698	40216046	40215772	Y	ATP6V0A1	DNAJC7,DHX58	RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC7	44304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	41162878	41163074	41162972	Y	TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4	AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	IFI35	6136	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	41500242	41500532	41500387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX8	58701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH8	55222	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	43230123	43230516	43230320	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	5551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	43389475	43389771	43389724	Y	FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14	MAP3K14	TEX34,LOC100133991	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	2643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	43817871	43818233	43818138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	251756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	565835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	598973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	556659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	45798483	45798953	45798740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	73641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46091721	46092069	46091883	Y	NA	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	SP2,PNPO,CDK5RAP3,PRR15L	IMR90	Hi-C	24141950	COPZ2	21323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	55265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46377133	46377263	46377218	Y	NA	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	7424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46395351	46395518	46395501	Y	NA	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	25642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	11438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	10719	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	46647653	46647800	46647722	Y	HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7673	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	3981	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	48105546	48105721	48105634	Y	ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	25611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48338432	48338651	48338443	Y	EPN3	TMEM92	LOC284080,ITGA3,PDK2,SAMD14,PPP1R9B,COL1A1,HILS1,SGCA,TMEM92	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM92	8116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr17	48467638	48467952	48467795	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1,LRRC59,ACSF2	NA	NA	NA	NA	LRRC59	4962	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	49983117	49983475	49983437	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	647228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC102948.2	375656	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	50795913	50796132	50795928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC102948.2	141349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	52328438	52328710	52328574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	646038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	53535750	53535979	53535892	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	38397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	53875650	53875676	53875663	Y	NA	PCTP	NA	NA	NA	NA	PCTP	49310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	54864431	54864801	54864568	Y	TRIM25,SCPEP1	DGKE,C17orf67	NA	NA	NA	NA	DGKE	44659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	55517850	55518075	55517943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	186638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr17	55518270	55518753	55518516	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	187058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	55628691	55629280	55629007	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	296137	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	55690023	55690365	55690280	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	235052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	55938337	55938724	55938439	Y	SUPT4H1,CUEDC1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	55993641	55993992	55993778	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	36692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	56020686	56021039	56020762	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	9645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	56468859	56469318	56469005	Y	RNF43	SUPT4H1,RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	23638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57844650	57844791	57844732	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	61663	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	57975372	57975465	57975395	Y	NA	TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	RPS6KB1	6925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	59018495	59018735	59018604	Y	NA	NA	TBX2,C17orf82	IMR90	Hi-C	24141950	BCAS3	265681	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62154723	62155082	62154942	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	51097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	62966198	62966382	62966326	Y	DDX5,CEP95,RGS9,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	3312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	63552177	63552345	63552261	Y	NA	AXIN2	NA	NA	NA	NA	AXIN2	3420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	63747410	63747660	63747535	Y	CEP112,CEP112,AXIN2	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	191645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	64128284	64128318	64128301	Y	CEP112,CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	57884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	64796276	64796554	64796503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	443551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	65477756	65478333	65478203	Y	HELZ,PSMD12	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD12	117013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	66315636	66315845	66315767	Y	BPTF,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ2	73921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	70335121	70335458	70335290	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9-AS1	119144	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	179740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	70398105	70398184	70398145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	182128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	187704	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70407350	70407568	70407445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	191373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70416079	70416357	70416132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	200102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9-AS1	201238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	9.34763104613497
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	70432780	70433062	70433017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	188308	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr17	70443498	70443728	70443613	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	177642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70512872	70513243	70513164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	108127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr17	70585924	70586379	70586141	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	34991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	70628447	70628581	70628499	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	6030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	71768	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00511	77797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	71439964	71440055	71440021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	133650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	72278744	72279201	72278906	Y	TMEM104,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,TTYH2,DNAI2	KIF19	NA	NA	NA	NA	KIF19	41148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	145779	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	72633570	72634215	72633653	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300LF,CD300E	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A3R1	108576	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	72686594	72686880	72686692	Y	TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	55911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr17	73734249	73734591	73734388	Y	GGA3,GRB2,GRB2,WBP2,UNC13D,ACOX1,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B	ITGB4,GALK1,UNK,H3F3B	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18841	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	12787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	43539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.94849248390407
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	74752987	74753327	74752991	Y	NA	JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	SRSF2	21531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75096190	75096538	75096428	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	15392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr17	75167597	75167895	75167730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	86799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75251434	75251777	75251766	Y	NA	NA	SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00338,SEC14L1	170636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	303838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75405377	75405733	75405639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	324579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75882477	75882802	75882634	Y	TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	115447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	15.296123530039
chr17	76247000	76247249	76247129	Y	TMEM235	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	38733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76320464	76321292	76320695	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	32866	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76744782	76745072	76745044	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	31307	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76767876	76768189	76768026	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	8190	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	76875667	76876103	76875916	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	USP36	40144	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr17	77815657	77816173	77815945	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	4429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	77959820	77960211	77960016	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	47436	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr17	77970749	77971301	77971166	Y	CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	36346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78098181	78098723	78098426	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	20259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78102448	78102482	78102466	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	16500	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3,SLC26A11,SGSH	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr17	78431372	78431666	78431608	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	44407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78747875	78748340	78748187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	215058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78844194	78844503	78844331	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	118895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	79018501	79018654	79018571	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	11553	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	79024187	79024380	79024262	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	17239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79261011	79261270	79261067	Y	NA	C17orf89,SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	6077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	79339701	79340108	79339894	Y	NA	TMEM105	SLC38A10,NPLOC4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	37227	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	79363961	79364269	79364114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	61487	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	79421564	79421842	79421610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	56247	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	79698331	79698466	79698406	Y	TMEM105	HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10	NA	NA	NA	NA	SLC25A10	29927	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,NPB,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	80292742	80293207	80293087	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	SECTM1,TEX19	NA	NA	NA	NA	SECTM1	2792	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	27471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	86105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	125269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	126640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr17	80840475	80841074	80840735	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	132535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr17	81031472	81031760	81031658	Y	METRNL	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1	K562	ChIA-PET	22265404	METRNL	3807	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr18	6556939	6557309	6557113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	95925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	6624543	6624930	6624551	Y	NA	NA	LOC100130480,ARHGAP28	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P27	163529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	8730480	8730718	8730581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	123037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	8803155	8803225	8803221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	195712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9456186	9456568	9456377	Y	NA	RALBP1	TWSG1,ANKRD12,RALBP1,PPP4R1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALBP1	16439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9613164	9613539	9613352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	NA	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	AFG3L2	86816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr18	12336380	12336603	12336512	Y	NA	AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	38710	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	PSMG2	NA	NA	NA	NA	PSMG2	15405	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	13382338	13382799	13382497	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	341860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.45493340605565
chr18	13408431	13408818	13408626	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	315841	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	21091625	21091887	21091629	Y	C18orf8	C18orf8	NA	NA	NA	NA	C18orf8	10152	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	22730586	22730811	22730699	Y	ZNF521	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	938370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	23836366	23836416	23836389	Y	TAF4B	TAF4B	NA	NA	NA	NA	TAF4B	32466	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr18	28823621	28824065	28823663	Y	NA	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	143243	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	29354326	29354665	29354429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	176434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	29952485	29952862	29952679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	282667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	33040584	33040905	33040747	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	35050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	33737531	33737917	33737788	Y	NA	SLC39A6,ELP2,MOCOS	NA	NA	NA	NA	MOCOS	27565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	34547272	34547713	34547483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	140114	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	34915511	34915689	34915620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	508353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	39898716	39899231	39898870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	365545	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	63676	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46459367	46459671	46459607	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	15410	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46460097	46460351	46460248	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	14730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46482815	46483020	46482939	Y	NA	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.6437744372907
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47512458	47512491	47512475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA2	174128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47620136	47620367	47620252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	99096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47626417	47626670	47626561	Y	MYO5B,MBD1,MBD1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	92793	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47688363	47688450	47688407	Y	NA	MYO5B	NA	NA	NA	NA	MYO5B	31013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	11419	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr18	53004994	53005474	53005290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	380255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	54236366	54236540	54236437	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	80034	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	55671810	55671869	55671840	Y	NA	NEDD4L	NEDD4L,ATP8B1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4L	37730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	55863542	55863917	55863628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	153943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr18	55892299	55892691	55892549	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	182700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	56012421	56012506	56012466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	253357	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	56672148	56672229	56672220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	132480	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr18	60598497	60598585	60598560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	217825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	72501282	72501640	72501447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	238176	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	72779359	72779673	72779506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	139630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	72916177	72916455	72916218	Y	NA	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	2848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	241437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	75697384	75697771	75697683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1129514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	188995	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	283297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	218952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr18	77245359	77245518	77245445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	192283	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr18	77394218	77394591	77394404	Y	NA	CTDP1	ATP9B,NFATC1	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	43210	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	HMHA1,POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1133542	1133865	1133752	Y	C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	31606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.98283082796802
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1284432	1284856	1284552	Y	REEP6,ONECUT3,GAMT,EFNA2	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	EFNA2	279	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	1669192	1669298	1669247	Y	C19orf26,EFNA2,APC2,TCF3,TCF3	TCF3	TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	18588	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	ONECUT3	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ONECUT3	2822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr19	1755338	1755626	1755509	Y	NA	ONECUT3	NA	NA	NA	NA	ONECUT3	4966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	1763363	1763749	1763439	Y	NA	ONECUT3,ATP8B3	NA	NA	NA	NA	ONECUT3	12991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	1942586	1943099	1942836	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	2627461	2627884	2627646	Y	DOT1L,OAZ1,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	72823	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3404098	3404373	3404237	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	46537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	C19orf77	NA	NA	NA	NA	C19orf77	49428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	3617364	3617743	3617529	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	12526	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4061318	4061457	4061400	Y	SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	3486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4084320	4084813	4084566	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	19377	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6062045	6062746	6062500	Y	TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	85892	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	PEX11G,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	11959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	9973694	9973855	9973758	Y	ZNF266,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	29761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	10138488	10138727	10138608	Y	EIF3G,COL5A3	COL5A3,C3P1	NA	NA	NA	NA	C3P1	7752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	10148101	10148280	10148177	Y	NA	COL5A3,C3P1,C19orf66	NA	NA	NA	NA	C3P1	1622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr19	10148640	10148857	10148749	Y	NA	COL5A3,C3P1,C19orf66	NA	NA	NA	NA	C3P1	2161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,SNORD105B,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	10562469	10562629	10562543	Y	NA	KEAP1	NA	NA	NA	NA	KEAP1	49788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr19	13095998	13096573	13096246	Y	ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	7849	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13232805	13233031	13232944	Y	WDR83,JUNB	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	5888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	13445795	13446271	13446068	Y	SYCE2	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	186566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	13783472	13783589	13783575	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	56985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	13855893	13856042	13855968	Y	NA	CCDC130,MRI1,C19orf53,ZSWIM4	MRI1,C19orf53	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC130	15319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	16163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NANOS3	NA	NA	NA	NA	NANOS3	11491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	NANOS3,CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	NANOS3	5868	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	NANOS3,CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	16492713	16493267	16492962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	16493561	16493905	16493595	Y	KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	18811913	18812040	18811994	Y	UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	19426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	19701908	19702346	19702068	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	PBX4,LPAR2	NA	NA	NA	NA	PBX4	25379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	19705357	19705479	19705434	Y	NA	PBX4,LPAR2,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	22246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	21882044	21882358	21882227	Y	ZNF676,ZNF208	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	66072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	31705006	31705320	31705186	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF507	1129180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	992173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA2	75456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	35784331	35784508	35784434	Y	ZNF30,SCN1B,HPN,LGI4,FXYD1,FXYD7,MAG,ARHGAP33	LSR,USF2,HAMP	NA	NA	NA	NA	HAMP	14712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	HAMP	NA	NA	NA	NA	HAMP	40060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF527	93353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10,CNTD2	NA	NA	NA	NA	CNTD2	4528	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	42430880	42431141	42430883	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	30401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	LYPD3	131970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr19	44139252	44139636	44139395	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF225,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,IRGQ,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	2355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	44267676	44267996	44267772	Y	TEX101,LYPD3,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	10534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	45205949	45206135	45206066	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	42827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	45604142	45604476	45604278	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	11488	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	59077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	46975956	46976146	46976053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	83752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.17167185920307
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	49151515	49151640	49151575	Y	NA	SPHK2,RPL18,DBP,FUT2	NA	NA	NA	NA	DBP	12820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	KCNA7,SNRNP70,LIN7B,C19orf73	NA	NA	NA	NA	KCNA7	2805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	50317454	50317522	50317488	Y	PTH2	AP2A1,MED25,PTOV1	NA	NA	NA	NA	MED25	2017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	31081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	52052884	52053120	52052983	Y	NA	SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF175	19431	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	52323338	52323678	52323420	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF350	164431	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr19	53449736	53449992	53449814	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	5882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF765	163185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,PRKCG	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	55038222	55038527	55038355	Y	NA	NA	KIR3DX1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP5	55811	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	55798938	55799371	55799231	Y	SYT5,SHISA7,BRSK1	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1,SUV420H2	NA	NA	NA	NA	BRSK1	7498	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	55960580	55961094	55961009	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628	NA	NA	NA	NA	ISOC2	10616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	46108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF551	27142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF329	106821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	605283	605589	605326	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	SH3YL1	340885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	1590812	1591204	1590899	Y	NA	NA	PXDN,MYT1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3YL1	1326414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	1343639	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	1394784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	1721166	1721471	1721224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	1456768	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	1457752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	7171830	7172101	7171947	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK2	167064	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	8149214	8149569	8149294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	572353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	8231020	8231604	8231329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	490318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	8259183	8259343	8259265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	462579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	8767111	8767480	8767322	Y	NA	AC011747.4,ID2	LINC00299,LOC339788,LOC100506274	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	45189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	NA	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	93617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	10418251	10419155	10418675	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	21860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	10721200	10721506	10721353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL10	106595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	10984211	10984590	10984279	Y	NA	PDIA6	C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDIA6	8108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	11547236	11547448	11547321	Y	NA	NA	ROCK2,PQLC3,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	56849	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	11562098	11562245	11562172	Y	NA	E2F6	NA	NA	NA	NA	E2F6	42052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	11837707	11837887	11837797	Y	E2F6,LPIN1	LPIN1,AC106875.1	GREB1,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC106875.1	18121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	12703502	12703613	12703558	Y	NA	NA	TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	151402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	15782224	15782403	15782250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	52922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	15815563	15815811	15815751	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	86261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr2	20412281	20412403	20412381	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10791	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	20432677	20432919	20432791	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	9483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	20776456	20776666	20776584	Y	HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	72183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	20849276	20849608	20849479	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	23609943	23610311	23610250	Y	KLHL29	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	3855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	23631132	23631189	23631161	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	25044	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	23743180	23743526	23743353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	137092	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	27942982	27943239	27943170	Y	RBKS	AC074091.13,MRPL33	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	6383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28137373	28137669	28137575	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	25408	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	28579030	28579220	28579083	Y	RBKS,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	34095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28583371	28583537	28583468	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	29778	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28589272	28589573	28589455	Y	FOSL2	FOSL2,AC104695.3	BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSL2	23742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.23175403075664
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	29050679	29050871	29050775	Y	NA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	40296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	NA	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	WDR43	215713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	233687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	30063514	30063882	30063849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL5	303925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL5	72855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	30448125	30448425	30448217	Y	YPEL5,LBH	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL5	80318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	30788063	30788262	30788163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	119971	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	221173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	33702756	33702976	33702846	Y	RASGRP3,RASGRP3	RASGRP3	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	43365	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37308622	37308977	37308800	Y	NA	HEATR5B	NA	NA	NA	NA	HEATR5B	508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	147026	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	148815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr2	37622307	37622582	37622438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	165451	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	37760471	37760598	37760536	Y	SULT6B1,FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	203013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200099	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	37782769	37783216	37782856	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	180395	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	37808694	37808848	37808817	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	154763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr2	37815586	37815764	37815605	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	147847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	37841378	37841620	37841452	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	121991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37842733	37843439	37843059	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	120172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37853380	37853621	37853410	Y	EIF2AK2,EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	109990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	37885188	37885619	37885408	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	77992	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	37892431	37892964	37892857	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	70647	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	69638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37940534	37940802	37940700	Y	CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	22809	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	37972203	37972477	37972340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	8592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	37995727	37996117	37995888	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	32116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38003207	38003253	38003231	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	39596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38009959	38010423	38010225	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	46348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	38333760	38333892	38333836	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P12	122818	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38418747	38419129	38419037	Y	NA	RPL7P12	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	37581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38599092	38599284	38599189	Y	FAM82A1	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	3143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	38621174	38621326	38621250	Y	NA	ATL2	ATL2,HNRPLL,SRSF7,DHX57,FAM82A1,GALM	IMR90	Hi-C	24141950	ATL2	18747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	39443973	39444333	39444109	Y	SOS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOS1	94487	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	123460	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	42368526	42368635	42368598	Y	NA	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43197884	43198002	43197975	Y	NA	AC016735.1	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.1	33198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	37567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	43361205	43361386	43361340	Y	OXER1,ZFP36L2,THADA,THADA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	90362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43685237	43685474	43685356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	43762812	43762910	43762862	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	58275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	44471855	44471912	44471885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1B	78747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr2	47526778	47526800	47526792	Y	KCNK12	AC073283.4,EPCAM	TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	43413	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	48373241	48373406	48373298	Y	FOXN2	NA	FOXN2,PPP1R21	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	166370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	48392535	48392754	48392657	Y	FBXO11,FBXO11,FOXN2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN2	147022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	48475818	48475987	48475845	Y	NA	NA	FOXN2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	63789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	50468354	50468602	50468556	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1713832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	53079014	53079114	53079064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	913815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	53240850	53241038	53241011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	751891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	161250	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	160872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr2	54861793	54862155	54861956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	86481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	56112478	56112793	56112711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPT1	193433	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	58347874	58348075	58347917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	118432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	997477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	60327078	60327537	60327382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	653828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	269867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	223604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr2	62424513	62424632	62424578	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	3265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	62806044	62806443	62806244	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	92543	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr2	66652427	66652950	66652646	Y	MEIS1	MEIS1	LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	5634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	69390293	69390547	69390355	Y	ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	221835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70154281	70154743	70154417	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	31461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70170844	70171172	70170945	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	16225	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70216700	70217012	70216811	Y	NA	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	29303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3	NA	NA	NA	NA	AC016700.3	34707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	70667389	70667575	70667482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	111750	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	EMX1	92366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr2	75076703	75076941	75076867	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	17595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	75089962	75090221	75090092	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	30854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	77125916	77126288	77126102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	887220	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	82212744	82213103	82212921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	830152	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	29587	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr2	88590567	88590888	88590740	Y	C2orf51	NA	NA	NA	NA	NA	KRCC1	237319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	91773979	91774217	91774117	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	2784817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	91960340	91960566	91960493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2971178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	97428705	97428844	97428785	Y	NA	LMAN2L,CNNM4	NA	NA	NA	NA	CNNM4	4066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	97579294	97579390	97579355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	57462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	98910663	98910871	98910767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	148446	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	99307845	99308079	99307957	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	MGAT4A	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	37510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	525815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCL3	269207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	101270237	101270473	101270387	Y	RPL31	NA	NPAS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDCL3	93085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr2	102241918	102242303	102242103	Y	RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4	NA	RFX8,MAP4K4,CREG2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K4	69009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	102399741	102400097	102399970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	88429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	105505799	105505908	105505854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	146533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	110097588	110097865	110097829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	271918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	112375521	112375561	112375551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	264706	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	112376562	112376898	112376751	Y	BCL2L11	NA	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	263369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	113571140	113571483	113571425	Y	IL37,IL1A	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	20997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	113573367	113573750	113573559	Y	IL1A	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	18730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	15948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	113643095	113643585	113643305	Y	IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G	NA	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1B	50615	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	113835949	113836406	113836219	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	PSD4	76496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	113924878	113925123	113925003	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2	PSD4,PAX8-AS1	PSD4	K562	ChIA-PET	22265404	PSD4	11976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	114163815	114164191	114163891	Y	NA	NA	IL1RN	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	175473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	115355996	115356162	115356079	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	710459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	119498698	119498987	119498818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	480397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	120222602	120222796	120222714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DBI	100105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	121155649	121155973	121155708	Y	INHBB	NA	LOC84931,INHBB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	160009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	121156856	121157127	121156991	Y	INHBB	NA	INHBB,LOC84931	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RALB	161216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALB	204727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	121943239	121943562	121943401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFCP2L1	97221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2B	736193	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr2	131058181	131058640	131058440	Y	NA	AC068137.13,IMP4,CCDC115	NA	NA	NA	NA	AC068137.13	8786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC115	51411	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	134786120	134786182	134786152	Y	NA	NA	MGAT5	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5	89372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	129862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	151385999	151386295	151386059	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	7230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	58533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	154379200	154379581	154379374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	68220	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	157314368	157314516	157314443	Y	NR4A2,GPD2	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	24566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	158118717	158119062	158118890	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	6607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	159951081	159951241	159951194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TANC1	127935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	159994086	159994676	159994284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	146634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.17167185920307
chr2	160057929	160058272	160058017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	83038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH7	79880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	160804631	160804934	160804783	Y	NA	LY75-CD302,LY75	NA	NA	NA	NA	LY75	45371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	29547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	166983519	166983786	166983732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	175166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	168822360	168822564	168822456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	280087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	169058014	169058040	169058027	Y	B3GALT1	STK39	NA	NA	NA	NA	STK39	44611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	169816441	169816821	169816578	Y	ABCB11	SPC25	NA	NA	NA	NA	SPC25	48560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	172747551	172747817	172747684	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	29141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	173111540	173111762	173111691	Y	ITGA6	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	145912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	173116941	173117298	173117012	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	151313	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	173117910	173118399	173118084	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	152282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	173647954	173648254	173648105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093818.1	228630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	176425428	176425597	176425513	Y	ATF2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G3	378093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	180585338	180585678	180585637	Y	ZNF385B,ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	284162	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	182655515	182655597	182655556	Y	NA	NA	SSFA2,PPP1R1C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SSFA2	98963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR75	289007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	190235497	190235832	190235693	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	68327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	191861492	191861699	191861596	Y	STAT1	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	193718012	193718039	193718028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	1008031	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	197078069	197078253	197078160	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	38842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201167757	201168004	201167857	Y	SPATS2L,SPATS2L	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201794314	201794594	201794537	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1	PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	AC005037.3	31392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	202209480	202209837	202209779	Y	NA	STRADB	NA	NA	NA	NA	STRADB	40744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	203176830	203176888	203176863	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	48391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	203830057	203830223	203830140	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	47298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	215920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	192605	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	212368666	212368999	212368856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	1028290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	213339164	213339568	213339278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	1998788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	216216979	216217372	216217176	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	42439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	217035180	217035407	217035275	Y	NA	NA	PKI55	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC5	64993	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	223643125	223643256	223643191	Y	NA	NA	ACSL3,MOGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL3	80396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	286462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	224467803	224467963	224467901	Y	SCG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	232781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	225010758	225010857	225010808	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL44	190637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	230784453	230784592	230784556	Y	NA	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	231467403	231467585	231467498	Y	GPR55,SP110,SP110,SP140,SP140L,SP100,SP100	NA	SP140,SP110,CAB39,SP100,SP140L	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	107975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	231658746	231658958	231658902	Y	SP140L,SP100,SP100	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	68396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf72	77680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232330093	232330255	232330170	Y	NA	SNORD82,NCL	NA	NA	NA	NA	SNORD82	6942	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	99477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	232505425	232505799	232505482	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	63806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	234156397	234156705	234156566	Y	INPP5D,DGKD	ATG16L1,SCARNA5	NA	NA	NA	NA	SCARNA5	25668	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	234342075	234342448	234342262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	80922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A6,UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	32501	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236404372	236404974	236404689	Y	AGAP1	AGAP1,AGAP1-IT1	NA	NA	NA	NA	AGAP1	3639	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	76684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236514356	236514561	236514454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	101961	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236610513	236610911	236610705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	198118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236698901	236699175	236699041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	286506	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236842338	236842740	236842449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	429943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	236886303	236886528	236886416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	473908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	508840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	238092955	238093156	238093082	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	100495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	238609405	238609661	238609494	Y	MLPH,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	75186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	AC062017.1	450383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	175294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr2	240172512	240172646	240172579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	148484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240179337	240179507	240179411	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	141623	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240190277	240190476	240190405	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	130654	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.5321847496412
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	121201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr2	240207243	240207370	240207354	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	113760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240243731	240244004	240243870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	77126	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	241519364	241519647	241519506	Y	NA	DUSP28,RNPEPL1,ANKMY1,CAPN10	NA	NA	NA	NA	CAPN10	4486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	241561048	241561275	241561167	Y	DUSP28,RNPEPL1,CAPN10,GPR35	CAPN10	NA	NA	NA	NA	CAPN10	36915	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH,NEU4	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	1167289	1167675	1167648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMF1	75383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	SDCBP2,FKBP1A	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	25714	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	3961377	3961729	3961667	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	32500	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	4954142	4954446	4954407	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	34493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	5127563	5128387	5127720	Y	GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	CDS2	22131	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	6678677	6678999	6678684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	576486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	8456566	8456979	8456777	Y	TMX4,PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	458090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	466137	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	10472654	10473100	10472965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	59784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	13379016	13379145	13379075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	238442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	17593106	17593506	17593263	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	44598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNX5	116816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	17876337	17876490	17876431	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX5	71133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493	NA	NA	NA	NA	LINC00493	19812	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	19293639	19293701	19293669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	442651	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	19717747	19718119	19717916	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	18233	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	19731566	19731887	19731646	Y	NA	RP1-122P22.2	SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	4465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	19737104	19737460	19737269	Y	NA	RP1-122P22.2	SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr20	19860938	19861220	19861002	Y	NA	RIN2	SLC24A3,RIN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RIN2	3945	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	22471596	22471813	22471642	Y	FOXA2,FOXA2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	85467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	22804305	22804582	22804444	Y	NA	NA	THBD	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	223796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	23117564	23117783	23117655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	89186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	23123782	23124035	23123853	Y	NA	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	95404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	23140057	23140426	23140138	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	111679	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	24709936	24710315	24710275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CST7	217551	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	24931632	24932032	24931708	Y	CST7,C20orf3	CST7	NA	NA	NA	NA	CST7	3766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	24941460	24941976	24941729	Y	CST7,C20orf3	CST7	NA	NA	NA	NA	CST7	13594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr20	25226687	25226893	25226791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	166731	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr20	31126982	31127359	31127172	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	43517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	31872886	31873050	31872953	Y	BPIL1,PLUNC,C20orf114	BPIFB1	NA	NA	NA	NA	BPIFB1	13600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35633884	35634240	35634054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	55638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	35964748	35965459	35965134	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5629	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	35972053	35972195	35972121	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	36389387	36389716	36389551	Y	NA	NA	VSTM2L	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	68979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	39631777	39632207	39632178	Y	NA	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	23251	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FITM2	157171	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.45493340605565
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK4	96875	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	NA	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	SLPI	113496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43869504	43869693	43869682	Y	DBNDD2,SLPI	SLPI	NA	NA	NA	NA	SLPI	11512	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	44136889	44137182	44137082	Y	NA	WFDC2	NA	NA	NA	NA	WFDC2	40543	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF335	23299	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45526625	45526933	45526720	Y	NA	EYA2	NA	NA	NA	NA	EYA2	5362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45753033	45753220	45753133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	54529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45787211	45787318	45787265	Y	EYA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1050K3.3	88707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	46316176	46316372	46316269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	96988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	46429440	46429610	46429525	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	16080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr20	46601191	46601469	46601377	Y	SULF2,SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	187831	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	47373433	47373685	47373559	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	162742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48065517	48065771	48065626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD12	170297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	48212349	48213057	48212923	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT5	115358	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	48334324	48334539	48334447	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	B4GALT5	K562	ChIA-PET	22265404	B4GALT5	5909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr20	48610028	48610288	48610158	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	12492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48810888	48811172	48811109	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	5512	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49058248	49058472	49058381	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	66419	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49272019	49272462	49272221	Y	NA	NA	PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,ADNP	IMR90	Hi-C	24141950	PARD6B	73619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MOCS3	76973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS3	265173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	70300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	50361169	50361338	50361278	Y	NA	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	12097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	50527143	50527170	50527154	Y	NA	NA	ZFP64,SALL4,ATP9A	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9A	143970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	50601567	50601698	50601647	Y	NA	NA	ATP9A,SALL4,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP64	217149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	51591897	51592288	51592140	Y	TSHZ2,TSHZ2	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	4951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	51730635	51730659	51730647	Y	TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	143689	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	51775056	51775397	51775227	Y	TSHZ2,TSHZ2	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ2	188110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	SUMO1P1	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	43757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	SUMO1P1	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	24634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	SUMO1P1	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	42219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	75790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	52684102	52684485	52684350	Y	PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	137901	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52753645	52754029	52753762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	68357	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	PFDN4	NA	NA	NA	NA	PFDN4	37366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr20	54012587	54012833	54012710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL12P4	323432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	104986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38,RP4-800J21.3	NA	NA	NA	NA	RP4-800J21.3	2690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	56016094	56016430	56016231	Y	NA	RP4-800J21.3,HMGB1P1	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	45653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	56232830	56233085	56232989	Y	NA	ZBP1	NA	NA	NA	NA	ZBP1	39198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	56592800	56593208	56592856	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1L	289287	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr20	56705842	56706001	56705847	Y	NA	NA	ZBP1,PCK1,CTCFL,C20orf85	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	176494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	57300192	57300206	57300199	Y	NA	NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	38005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	58044917	58045137	58045090	Y	NA	NA	EDN3	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	428953	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	812000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr20	60247024	60247153	60247088	Y	CDH4,SS18L1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	391713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	60735261	60735480	60735370	Y	NA	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	18439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr20	61282674	61283033	61282738	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	10877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr20	61285550	61285806	61285682	Y	BHLHE23	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	RP11-93B14.5	10270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61317452	61317806	61317666	Y	DPH3P1,OGFR,SLCO4A1	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	RP11-93B14.5	21376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	15.7682261081267
chr20	61337130	61337323	61337237	Y	NA	RP11-93B14.5	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-93B14.5	41054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	61342361	61342694	61342588	Y	NA	RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	RP11-93B14.5	46285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61371030	61371150	61371083	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	63037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr20	61400175	61400479	61400325	Y	NA	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	33708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr20	61423534	61423709	61423679	Y	NA	OGFR,COL9A3	LAMA5,SLCO4A1,LOC100127888	MCF7	ChIA-PET	22265404	OGFR	10478	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	61553883	61554120	61553955	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	13184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	61585554	61585775	61585703	Y	SLC17A9	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61641732	61642015	61641970	Y	DIDO1,BHLHE23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	59680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61646020	61646413	61646169	Y	C20orf11,YTHDF1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	63968	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61724045	61724282	61724168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	121304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61804100	61804419	61804293	Y	DIDO1	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	41167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.1545026871711
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	62485386	62485810	62485510	Y	PRIC285	TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914,ARFRP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPD52L2	8786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.776820624701
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr20	62726888	62727073	62727008	Y	NA	RGS19	NA	NA	NA	NA	RGS19	17565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11063933	11064260	11064086	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	32720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	11082328	11082591	11082458	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	14389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	11090314	11090328	11090319	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	6652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11109153	11109188	11109171	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	12173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr21	11114307	11114424	11114412	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	17327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11118249	11118623	11118434	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	21269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11126930	11127071	11126959	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	29950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11128400	11128724	11128645	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	31420	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11130122	11130404	11130162	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	33142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	11174514	11174910	11174556	Y	NA	NA	BAGE5,TPTE	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	77534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	11184749	11185145	11184947	Y	BAGE2,BAGE	NA	NA	NA	NA	NA	BAGE2	87769	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	16064365	16064765	16064448	Y	HSPA13,SAMSN1,NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	310560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	19151902	19152070	19151981	Y	BTG3,C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	37633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	27285950	27286116	27286033	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	179966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	27335144	27335525	27335335	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	205921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	30590117	30590529	30590261	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	25725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	30927917	30928144	30928028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	363525	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	402990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	33670455	33670601	33670551	Y	NA	MIS18A	NA	NA	NA	NA	MIS18A	21075	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	34718616	34718973	34718794	Y	OLIG2,OLIG1	IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	23882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	35891449	35891717	35891494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	93724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	158530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	36185927	36186112	36186038	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	200486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	235308	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36223731	36223900	36223856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	238290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr21	36339843	36340239	36340159	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	354402	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36342558	36342757	36342568	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	357117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr21	36367475	36367815	36367753	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	382034	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36379576	36379916	36379746	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	394135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36392735	36393025	36392943	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	407294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36458819	36458923	36458887	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	473378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36599466	36599950	36599803	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	614025	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RCAN1	653222	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,AP000688.29,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	AP000688.29	10229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,AP000688.29,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	AP000688.29	10916	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	38062761	38063015	38062888	Y	NA	SIM2	CLDN14,HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	6418	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	39237518	39237709	39237636	Y	DYRK1A,KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	501426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	39525413	39525769	39525570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	649462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	39618516	39618880	39618566	Y	KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	556351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	39700000	39700188	39700119	Y	NA	NA	KCNJ15,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	475043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	40127775	40128062	40127985	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	47169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	40410057	40410205	40410134	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	143572	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	42543184	42543509	42543444	Y	BACE2	MIR3197,BACE2	NA	NA	NA	NA	BACE2	5456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	42879173	42879227	42879200	Y	FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2,SNORA32	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	21816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr21	43952961	43953452	43953160	Y	PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	RSPH1	38497	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44631329	44631684	44631488	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	105632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44727448	44727599	44727495	Y	PKNOX1,SIK1	LINC00322	LINC00313,SIK1,HSF2BP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00322	22320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.24892320278862
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	LINC00319	3069	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	LINC00319	2803	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00319	53521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	44942511	44942810	44942777	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00319	78030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	45154719	45155048	45154820	Y	NA	PDXK,CSTB	NA	NA	NA	NA	PDXK	17744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	45968847	45969150	45969078	Y	NA	C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	33748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46172768	46173172	46172977	Y	NA	TSPEAR,UBE2G2	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	43273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46349799	46350126	46349963	Y	KRTAP10-12	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	7799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr21	46749941	46750271	46750188	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	44128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	NA	NA	NA	NA	NA	POFUT2	118546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	82499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.49355907784842
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	USP41,ZNF74	NA	NA	NA	NA	ZNF74	26142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	88032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	24756229	24756614	24756466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	91363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	131881	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	53550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	25350277	25350613	25350445	Y	NA	NA	KIAA1671,TMEM211,SGSM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD56	55096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	25390259	25390306	25390285	Y	NA	NA	KIAA1671	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORD56	95078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	27107290	27107513	27107356	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	40560	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	27458965	27459161	27459063	Y	NA	NA	MN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	177454	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	27488405	27488660	27488521	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	206894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	440335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	247638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	29124446	29124891	29124760	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	11128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	29469912	29470391	29470070	Y	XBP1,KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	2846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	29505815	29505935	29505933	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	38749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30096148	30096264	30096206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT5	64736	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30390990	30391309	30391217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	113846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30440424	30440670	30440589	Y	MTMR3,OSM,CCDC157	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	163280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	30608541	30609106	30608754	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	31734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	30612739	30612994	30612810	Y	TBC1D10A,LIF	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	27846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30615216	30615605	30615417	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	25235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr22	30620211	30620567	30620379	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	20273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.11587701537832
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	9.06436949928239
chr22	30666798	30667328	30667040	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	16288	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	SEC14L2	10711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	31854917	31854933	31854925	Y	NA	SFI1,EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	SFI1	27741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	31945272	31945635	31945454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4ENIF1	55178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	32042427	32042918	32042716	Y	RNF185,LIMK2	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	13500	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	32447993	32448178	32448103	Y	NA	SC22CB-1E7.1,SLC5A1	NA	NA	NA	NA	SLC5A1	10974	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	32806612	32806674	32806643	Y	RFPL2,RFPL3,TIMP3	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	61989	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr22	33176423	33176673	33176603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	307760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	218635	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	35549716	35550091	35549904	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	74958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	35709404	35709640	35709485	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	16136	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	35745535	35745614	35745571	Y	NA	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	28740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36755336	36755467	36755407	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	26596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36866824	36867261	36867092	Y	NA	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	8816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	36924116	36924377	36924195	Y	NA	TXN2,FOXRED2,EIF3D	NA	NA	NA	NA	EIF3D	633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	37490501	37490532	37490517	Y	NA	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	44722	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	37558444	37558999	37558665	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	34426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	37703985	37704250	37704217	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	65497	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	MFNG,CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr22	38568765	38569142	38568994	Y	PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	26747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	38624836	38625209	38625138	Y	JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF	MAFF,PLA2G6,TMEM184B	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	25139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr22	38750839	38750902	38750852	Y	NA	CSNK1E	NA	NA	NA	NA	CSNK1E	41625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	39801832	39802048	39801979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3	87438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	39890901	39891082	39890968	Y	ATF4	ATF4,RPS19BP1	SMCR7L	IMR90	Hi-C	24141950	ATF4	22618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	40309233	40309614	40309424	Y	CACNA1I,GRAP2	UQCRFS1P1	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	UQCRFS1P1	39940	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	40384673	40384943	40384833	Y	FAM83F	FAM83F	NA	NA	NA	NA	FAM83F	4010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	41294862	41295130	41294948	Y	NA	ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	43781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	42345357	42345934	42345409	Y	NA	CENPM,WBP2NL	TNFRSF13C	K562	ChIA-PET	22265404	CENPM	4189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	42696920	42697075	42696965	Y	NA	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	66167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43165805	43166293	43166166	Y	NFAM1,ARFGAP3	NA	ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3	IMR90	Hi-C	24141950	ARFGAP3	85819	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43233624	43233705	43233665	Y	NA	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	18407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43327845	43328148	43328016	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	75733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	43740111	43740598	43740319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z99756.1	70150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	43809202	43809620	43809410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z99756.1	139241	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	44705061	44705332	44705192	Y	PARVB,PARVG,PARVG	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	186846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	45501114	45501367	45501144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	56295	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	45623668	45623768	45623700	Y	KIAA0930	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	10882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,UPK3A,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	UPK3A	13649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	120091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	46159997	46160538	46160082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	94319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	46408022	46408110	46408057	Y	NA	WNT7B,RP6-109B7.3,C22orf26	NA	NA	NA	NA	WNT7B	37013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	46444150	46444589	46444370	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	2996	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	46771050	46771392	46771204	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	46278	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	46775439	46775628	46775534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMU	50667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	1006237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	283617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr22	50622526	50622601	50622565	Y	NA	TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	TRABD	182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50740463	50740842	50740722	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	3214	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50741799	50742849	50742615	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	1207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	50838232	50838664	50838480	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	58499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,MIOX	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50908246	50908896	50908576	Y	IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,MIOX,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	2558	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,MIOX,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr22	50976397	50976540	50976449	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	7388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50976592	50977006	50976816	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	7583	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	50979060	50979802	50979496	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	10051	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr22	51051274	51051666	51051314	Y	NA	CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	12941	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	991989	992283	992135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRNT1	2174317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	488335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	8529087	8529361	8529226	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	12032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	8540908	8541201	8541046	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	8924124	8924195	8924160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	79262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	12512871	12513125	12512991	Y	PPARG,PPARG	TSEN2	PPARG,TSEN2,SYN2,TIMP4	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN2	10806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	13040844	13041238	13041111	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	71379	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	13083903	13084071	13084052	Y	NA	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	28546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	TPRXL	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPRXL	39580	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	14848047	14848355	14848186	Y	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf20	133441	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	15285479	15285699	15285585	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	39820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	17020237	17020570	17020404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	715531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	1073606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	978919	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	18691206	18691520	18691363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	113041	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	19648890	19649201	19649045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	337370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	23991964	23992189	23991965	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	5882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr3	28713649	28713858	28713754	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	325012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	30646968	30647109	30647039	Y	TGFBR2	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	974	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	30723230	30723490	30723363	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	77236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	32557705	32558097	32557882	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	14805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	37304089	37304216	37304152	Y	GOLGA4	GOLGA4,AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	20403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	37939195	37939560	37939378	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	37744	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	41158856	41159369	41159156	Y	NA	NA	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNB1	74959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	45688648	45689066	45688756	Y	LIMD1	SACM1L	SACM1L,LOC644714	IMR90	Hi-C	24141950	SACM1L	39482	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP,TREX1	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	52143667	52143964	52143845	Y	NA	POC1A	NA	NA	NA	NA	POC1A	42742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	53859957	53860202	53860080	Y	CACNA1D,CHDH	CHDH,IL17RB	NA	NA	NA	NA	CHDH	18215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	53897423	53897785	53897604	Y	NA	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	ACTR8	16444	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	54725134	54725214	54725174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SELK	801119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	1071536	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	56814931	56815295	56815113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	99666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA12	167147	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	57639210	57639572	57639391	Y	SLMAP,FAM116A	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	37360	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	57957829	57958015	57957905	Y	NA	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	34112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	58159699	58160034	58159862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	61199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	58321418	58321818	58321477	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	4811	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	58372741	58373260	58372916	Y	PXK,FAM107A	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	44324	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	58469083	58469272	58469182	Y	NA	KCTD6	NA	NA	NA	NA	KCTD6	6569	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD6	508369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	60013358	60013756	60013558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	1221377	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	60994842	60995056	60994945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	240077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	1005491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	66543351	66543557	66543448	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	6130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	658581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71176805	71177031	71176814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	454109	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71389278	71389380	71389331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	241760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71494304	71494367	71494336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	136773	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	71863099	71863325	71863212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4E3	61175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	72031687	72032090	72031981	Y	NA	NA	SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4E3	229763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	75472638	75472968	75472803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-413E6.1	199336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	75765975	75766371	75766287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF717	66363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	76605335	76605709	76605470	Y	ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	124166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-260O18.1	1212761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	172731	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	87382490	87382853	87382616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	108069	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	95940100	95940413	95940257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINA	1748888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINA	1352632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr3	97006900	97007017	97006959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MINA	682284	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	MINA	488722	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	NA	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD2	67208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr3	99751196	99751332	99751292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	80025	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	FILIP1L	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	48101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	101645465	101645839	101645546	Y	NA	NA	FAM55C,NFKBIZ,LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	100630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	101772370	101772526	101772446	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	FAM55C,LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	227535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	101825381	101825701	101825541	Y	NA	NA	LOC152225,FAM55C,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	280546	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	104014158	104014524	104014365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	1069229	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	104155776	104156155	104156140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALCAM	927598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	105549302	105549342	105549320	Y	CBLB	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	37054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	106944388	106944677	106944531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	295106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	107318808	107318949	107318879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	79025	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	107504411	107504731	107504449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	264628	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	110490435	110490524	110490469	Y	NA	NA	PVRL3-AS1,PVRL3	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL3	296394	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	NA	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATG3	116885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	114998646	114998840	114998743	Y	NA	NA	GAP43	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB20	134528	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	115511576	115511993	115511793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	647458	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr3	115556507	115556695	115556650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	692389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	694310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	115595102	115595314	115595123	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	730984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	912243	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119202050	119202231	119202120	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	13148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119230547	119230943	119230634	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	15168	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119237356	119237846	119237595	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	21977	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	NA	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	SLC41A3	167861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDC	65895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	CHCHD6	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	29403	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.54935392167317
chr3	127453672	127453937	127453742	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	63894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	127469268	127470071	127469577	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	69980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	127553991	127554142	127554067	Y	NA	MGLL	MCM2,PODXL2	IMR90	Hi-C	24141950	MGLL	13940	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	127632728	127633069	127632897	Y	KBTBD12	KBTBD12	KBTBD12,MCM2,PODXL2,ABTB1,MGLL,SEC61A1	IMR90	Hi-C	24141950	KBTBD12	653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	127655460	127655715	127655545	Y	KBTBD12	KBTBD12	NA	NA	NA	NA	KBTBD12	23385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	128310952	128311168	128311056	Y	DNAJB8,RAB7A,GATA2,GATA2,GATA2	NA	EEFSEC,GATA2,LOC90246	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	86750	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	128735204	128735460	128735306	Y	NA	KIAA1257	GP9	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1257	15671	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	129690304	129690667	129690526	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	79885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	130562630	130562648	130562639	Y	NA	ATP2C1	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	4791	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	134286307	134286601	134286455	Y	CEP63,CEP63,CEP63	EPHB1	NA	NA	NA	NA	EPHB1	28042	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	134357896	134357929	134357912	Y	NA	EPHB1	NA	NA	NA	NA	EPHB1	43253	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	136067042	136067151	136067097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	99894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	136950285	136950362	136950323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL20RB	287213	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	137768870	137769254	137769106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	63406	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC8	85955	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	NA	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIK3CB	82539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	139253953	139254145	139254018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	140714	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	141102647	141102881	141102782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	61592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-372E1.1	41258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	146224364	146224853	146224698	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	35798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD2	111539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	128818	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	136519	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	138036	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	150066449	150066620	150066527	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	57502	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	150982940	150983386	150983145	Y	P2RY14	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-64D22.2	502830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	156502026	156502257	156502105	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	24264	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	156837520	156837824	156837670	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	38725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr3	156839965	156840160	156840071	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	CCNL1	36389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	156847368	156847750	156847738	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	28799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	170979718	170979982	170979850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	196215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171075070	171075360	171075215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	100837	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171146057	171146176	171146159	Y	NA	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	30021	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	171494715	171495344	171494835	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	31396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	4090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	174984866	174985269	174985168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	449189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	180122489	180122783	180122636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	195135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	180475891	180475917	180475905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXR1	108012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr3	183257675	183258009	183257756	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	93347	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	185215412	185215562	185215482	Y	NA	TMEM41A	NA	NA	NA	NA	TMEM41A	567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	89948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	187573018	187573159	187573097	Y	BCL6	NA	NA	NA	NA	NA	BCL6	111503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	187948643	187949049	187948891	Y	LPP,LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	78798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	187729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	TPRG1-AS1	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	44756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	190252374	190252607	190252502	Y	CLDN1,IL1RAP	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	22534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	192561492	192561800	192561547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	72150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	193546369	193546601	193546485	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	13212	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	10830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	27726	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	28398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	CPN2	NA	NA	NA	NA	CPN2	29147	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	CPN2	NA	NA	NA	NA	CPN2	28151	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194048965	194049014	194048990	Y	NA	CPN2	NA	NA	NA	NA	CPN2	21043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194282077	194282468	194282283	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM44-AS1	20272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr3	194839135	194839291	194839213	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	27309	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194875742	194876159	194875826	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	9142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	32063	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	195627582	195627903	195627662	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	8913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	3591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	195633702	195634304	195633876	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	2512	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	196244998	196245175	196245085	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	RNF168	16359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	AC128709.2	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	AC128709.2	31588	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr3	197254564	197254715	197254640	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	43479	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr3	197461391	197461841	197461700	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	48171	48447	48418	Y	ZNF141	NA	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF876P	155952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	683740	684022	683889	Y	GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,MFSD7,PCGF3	NA	NA	NA	NA	MFSD7	2510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	873387	873975	873731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAK	50186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	10079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	1027686	1027967	1027729	Y	FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1	DGKQ,IDUA,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	25962	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	1049620	1049756	1049677	Y	NA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	47896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	3203733	3204143	3203890	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	88612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	3463022	3463837	3463465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	3485407	3485559	3485410	Y	DOK7	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	22374	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	6171690	6172033	6171999	Y	PPP2R2C,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	NA	WFS1	97543	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6172675	6172972	6172793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFS1	96604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6179706	6179940	6179759	Y	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	NA	WFS1	89636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	6912537	6913143	6912820	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	3568	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	6941693	6941980	6941913	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	32724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	79300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	7978189	7978377	7978271	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	38536	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	8098106	8098298	8098202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	60261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	8112180	8112452	8112336	Y	NA	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	46107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOX3	714305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	11029361	11029726	11029544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR572	338725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115L11.1	26707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	15907638	15908044	15907859	Y	FBXL5,BST1,FGFBP1	FGFBP1	BST1	IMR90	Hi-C	24141950	FGFBP1	30319	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	16125304	16125914	16125552	Y	NA	PROM1	PROM1	IMR90	Hi-C	24141950	PROM1	41303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	21173357	21173594	21173476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	477452	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	22676419	22676434	22676427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	51139	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	12848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	23947088	23947695	23947571	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	43376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	25402341	25402497	25402460	Y	NA	ANAPC4	NA	NA	NA	NA	ANAPC4	25506	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	25536997	25537326	25537166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC34A2	117597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	25867382	25867475	25867429	Y	SLC34A2	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	4000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	25881877	25882168	25881954	Y	RBPJ,SLC34A2,SEL1L3	SEL1L3	C4orf52,SEL1L3	IMR90	Hi-C	24141950	SEL1L3	18495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	26030013	26030421	26030185	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	132656	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	37074925	37075290	37075112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf19	378273	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	38083648	38084173	38083860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	123592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	38162520	38162833	38162765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	38312171	38312322	38312247	Y	KLF3	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF3	351495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	38607589	38607693	38607690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF3	56124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr4	38664467	38664838	38664653	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	38679741	38680082	38679809	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	15237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	39316114	39316675	39316347	Y	NA	RFC1	NA	NA	NA	NA	RFC1	49320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	39659267	39659273	39659270	Y	NA	RP11-539G18.2,UBE2K	LIAS,LOC401127,PDS5A,UBE2K	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-539G18.2	20507	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	39894546	39894889	39894718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	82687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	96893	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	279160	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	41148833	41148910	41148907	Y	LIMCH1,LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	67821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	56453376	56453745	56453528	Y	NA	CLOCK,NMU	NA	NA	NA	NA	CLOCK	42071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	7.45922073378447
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	69590341	69590581	69590489	Y	UGT2B17,UGT2A3,UGT2B15	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC1	376534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	69598714	69599110	69598795	Y	UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC1	384907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	69602663	69602782	69602708	Y	UGT2B15,UGT2B11,UGT2B7,UGT2A3,UGT2B10	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC1	388856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	71638038	71638166	71638102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSF1	65496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	RASSF6	NA	NA	NA	NA	RASSF6	19022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	74600296	74600729	74600594	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL8	3494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPGN	237657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr4	75554137	75554451	75554233	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	163445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr4	75556698	75556816	75556809	Y	EREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	161080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	75557908	75558335	75558035	Y	EREG,AREG	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	159561	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr4	77129675	77129810	77129753	Y	NAAA	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	SCARB2	3236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	77500789	77501039	77500904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	146536	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	77545422	77545888	77545544	Y	SCARB2	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	191169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	77705263	77705447	77705355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	111555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	78979777	78980204	78980085	Y	NA	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	3053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	79473983	79474151	79474067	Y	ANXA3	ANXA3	NA	NA	NA	NA	ANXA3	3310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	80131303	80131759	80131432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	272711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	80520005	80520295	80520150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	524313	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	83205945	83206187	83206036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	87469	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	83943999	83944392	83944084	Y	THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2	LIN54,COPS4	LIN54,COPS4	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS4	9208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	88008599	88008816	88008710	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	139323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1019048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr4	93104192	93104578	93104286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2022184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	100762441	100762737	100762463	Y	RG9MTD2,LAMTOR3,DAPP1	DAPP1	NA	NA	NA	NA	DAPP1	26451	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	103596395	103596588	103596491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	83563	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	105980538	105980953	105980680	Y	TET2,TET2	NA	TET2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TET2	84079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	107164804	107165067	107164936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIMP1	69634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	108819119	108819373	108819246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS2	75400	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	109318263	109318610	109318312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34-AS1	221006	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	113095488	113095850	113095539	Y	NA	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	30935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	31.8197137631059
chr4	114382932	114383313	114383209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	297770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	114730352	114730805	114730660	Y	NA	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	49269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	116100188	116100506	116100348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGT8	582577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	43041	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	121561847	121561947	121561897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	575618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	122610538	122611647	122611314	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	4621	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	124401120	124401258	124401189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	85170	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	139067903	139068306	139067999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	93197	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	139177153	139177364	139177274	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	15650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	140017684	140017800	140017744	Y	RAB33B,ELF2	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	78572	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	140074901	140075184	140075104	Y	NA	ELF2	CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1	IMR90	Hi-C	24141950	ELF2	21188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	140787614	140787718	140787639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	202692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	NA	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAML3	100937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	142564611	142565296	142564927	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	8859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	161001	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	146944868	146944970	146944919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	149867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	154127038	154127322	154127172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	55544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	154127862	154128178	154128020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	56368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	83008	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	154176673	154176745	154176706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	87056	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	154235645	154236052	154235798	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	27749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	154361957	154362025	154361991	Y	NA	KIAA0922	MND1,TRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0922	23473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLRG1	230315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	157811355	157811573	157811537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSO	938286	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	159015926	159016366	159016169	Y	NA	NA	FAM198B	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM198B	76104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	160191202	160191310	160191258	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	502912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	169479701	169480223	169479961	Y	NA	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	22764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	184376829	184376946	184376888	Y	CLDN24	CDKN2AIP,ING2	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	13085	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	184751768	184752101	184751917	Y	NA	NA	ENPP6,STOX2,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	173348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	277975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr4	185201876	185202105	185201989	Y	IRF2	NA	IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	191629	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185205400	185205552	185205478	Y	NA	NA	IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	188182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr4	185306912	185307204	185307108	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	86530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185393561	185393895	185393573	Y	ACSL1,CASP3,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr4	185740732	185741181	185740991	Y	NA	ACSL1	NA	NA	NA	NA	ACSL1	4791	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	LRP2BP,ANKRD37,UFSP2	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	9005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	186628790	186629146	186629018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC110	237877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	187491323	187491675	187491487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	154201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.51501557760922
chr4	187621819	187622251	187622136	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.06008217155357
chr4	187622574	187622751	187622592	Y	FAT1	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	190708353	190708364	190708359	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	151579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	151095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.58797959346595
chr5	325619	325847	325735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6	55883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	379590	379862	379712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	61396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	394851	394874	394864	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	46384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	448928	449328	449227	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7655	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	496367	496484	496443	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	25963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	13.2188721864535
chr5	499612	499979	499932	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	22468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	30.403406028843
chr5	523225	523441	523256	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	778	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	557070	557448	557336	Y	NA	SLC9A3	SLC9A3,TPPP,CEP72	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A3	34623	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	601191	601577	601476	Y	PLEKHG4B,SLC9A3,CEP72	CEP72	SLC9A3,CEP72	IMR90	Hi-C	24141950	CEP72	8810	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.6652309370515
chr5	957591	958302	957640	Y	NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	RP11-43F13.3	37121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	1110480	1111164	1110500	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	1111223	1111556	1111501	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	1073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	1129967	1130071	1130019	Y	SLC12A7	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	19817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	4.9098668121113
chr5	1155287	1155504	1155358	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	45137	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	1156282	1156691	1156630	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	46132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	1930136	1931342	1930853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	130622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	3304230	3304631	3304430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1504716	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	3311711	3311862	3311757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1512197	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.92703598414327
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	SNHG18	137329	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	10303912	10303996	10303954	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	2142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	63616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	14109130	14109647	14109337	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	14204877	14205144	14204973	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	63066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	24132806	24133151	24133050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	676439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	32349231	32349269	32349250	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	38116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	32582779	32582965	32582856	Y	SUB1	NA	ZFR,SUB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUB1	53040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRIX1	327529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	35405015	35405048	35405025	Y	NA	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPEF2	210898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	CARD6	128653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	41113994	41114275	41114076	Y	NA	NA	C7,C6	IMR90	Hi-C	24141950	CARD6	274708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	41793312	41793500	41793406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	75121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	42468582	42468751	42468671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC152	286152	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	49653216	49653308	49653301	Y	PARP8	NA	NA	NA	NA	NA	PARP8	306425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA2	50178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	53598110	53598544	53598224	Y	NA	ARL15	NA	NA	NA	NA	ARL15	5868	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	54896440	54896979	54896639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	67562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	54964345	54964561	54964453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A9	102461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	55655118	55655221	55655151	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	55967437	55967663	55967602	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAP3K1	141738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	964250	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	914712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	60710257	60710608	60710433	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	24559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	63934985	63935195	63935090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	127317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	145831	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	67066519	67066839	67066639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	442709	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	67294770	67295126	67294965	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	214422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	67437910	67437942	67437925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	71606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr5	68608364	68608565	68608447	Y	CCDC125	CCDC125,CHCHD2P2	NA	NA	NA	NA	CCDC125	18071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	337395	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	71643596	71644131	71643868	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	29123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	97865	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr5	77765293	77765351	77765322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	110954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	77819717	77819752	77819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	165378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATG10	117781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	81319192	81319550	81319375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG10	53348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	81465137	81465359	81465307	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	107037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	82224684	82224708	82224696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	146609	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	82307578	82308063	82307728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	63254	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	87214641	87214647	87214644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM161B-AS1	348065	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	87967371	87967797	87967486	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	291597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	88120689	88121105	88120942	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	444915	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	90355365	90355552	90355477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUCAT1	252667	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	92913655	92914013	92913834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	103360	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr5	106725486	106725757	106725607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	278839	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	106802102	106802350	106802226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	202246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	106908701	106908838	106908775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	95758	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	107272988	107273215	107273140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	268392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	110846985	110847356	110847238	Y	WDR36,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	697	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	111181854	111182145	111181999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	312078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	5.57081042143397
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	115157919	115158169	115158044	Y	LOC644100	AP3S1,ATG12	NA	NA	NA	NA	AP3S1	17009	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr5	123739028	123739231	123739141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	343269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	94.2316745862899
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	124029260	124029627	124029444	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	52873	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	130714603	130715158	130715088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	135417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	130730635	130730890	130730763	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	151449	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	130750368	130750574	130750471	Y	CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	171182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	27226	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56,AC116366.5	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr5	131763102	131763516	131763179	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.5,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	AC116366.5	2696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	131828322	131828808	131828525	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	3832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	133458261	133458756	133458481	Y	UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	9859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr5	133880902	133881116	133881009	Y	PCBD2,CDKL3,PHF15	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	40659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	103128	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	107098	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	135885544	135885599	135885577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	305718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	135943812	135943901	135943857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	247416	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	137075973	137076263	137076118	Y	NA	KLHL3,HNRNPA0	NA	NA	NA	NA	KLHL3	6194	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	137577805	137577952	137577879	Y	NA	CDC23	NA	NA	NA	NA	CDC23	30773	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	138058227	138058591	138058405	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	28407	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	138263528	138263871	138263700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	176530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	139015811	139016118	139015905	Y	MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	8766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139568486	139568801	139568644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	83124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr5	139641396	139641769	139641570	Y	SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	38937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	CTC-329D1.3,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	9421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGB7	80212	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	140900821	140901187	140900923	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	95435	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	85728	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	141407173	141407212	141407192	Y	NA	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GNPDA1	16567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	141475352	141475622	141475404	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,ARAP3,FCHSD1,RNF14,GNPDA1,PCDH12	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	10448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	141615988	141616150	141616110	Y	NA	NA	FGF1,NDFIP1,SPRY4	IMR90	Hi-C	24141950	AC005592.2	86708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	142339728	142340345	142340014	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	191779	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	142383259	142383413	142383268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	235310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	142584878	142585235	142585051	Y	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	124935	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	142600445	142600900	142600783	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	109270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	142985989	142986227	142986124	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NR3C1,ARHGAP26,HMHB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P21	275819	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	146268013	146268084	146268061	Y	STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P48	182850	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	146717671	146717861	146717758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK32A	105145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	147184120	147184352	147184236	Y	SPINK14,JAKMIP2	SPINK1	NA	NA	NA	NA	SPINK1	24997	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf46	179727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	148188522	148188838	148188742	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	15318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	148349939	148350092	148350025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	90634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr5	148600871	148601299	148600941	Y	ARHGEF37,SH3TC2	NA	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	81825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	149789263	149789759	149789627	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74	CD74,RPS14	NA	NA	NA	NA	CD74	733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	150261861	150262245	150261884	Y	IRGM	ZNF300	NA	NA	NA	NA	ZNF300	20300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	150630662	150630980	150630918	Y	NA	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	CCDC69	28956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr5	150902961	150903053	150903007	Y	FAT2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	88354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	157029541	157029807	157029692	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	NA	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	THG1L	126398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	169232585	169232701	169232645	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	1054173	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	170179191	170179549	170179383	Y	GABRP	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	107325	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	171605314	171605550	171605494	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	7840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172209593	172209865	172209663	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	13395	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	172281377	172281706	172281433	Y	DUSP1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	22099	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172283530	172283741	172283563	Y	NA	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	24252	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172328085	172328386	172328247	Y	DUSP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	55346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172883833	172884047	172883943	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	157616	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	172899322	172899544	172899428	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	142119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	173300199	173300299	173300265	Y	NA	CPEB4	BOD1,CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	12984	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267A15.1	174378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	173888869	173889090	173888998	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	127571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	174472825	174472846	174472836	Y	NA	NA	FLJ16171,DRD1	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	323289	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44,CDHR2	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	175974830	175975038	175974917	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2	RNF44,CDHR2	NA	NA	NA	NA	CDHR2	7318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	176250127	176250448	176250189	Y	GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN17	177739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	176250976	176251175	176251072	Y	UNC5A	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN17	178588	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	178255974	178256130	178256077	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	28824	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr5	178257722	178258121	178258094	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	26833	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	16.4291697174493
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	179967202	179967410	179967248	Y	NA	CNOT6	NA	NA	NA	NA	CNOT6	47790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	180285670	180285966	180285744	Y	NA	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	ZFP62	320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	293338	293822	293579	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	3708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	399829	400349	400039	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	110199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	1055850	1056126	1055989	Y	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	254549	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chr6	1250840	1251149	1250977	Y	NA	NA	EXOC2,LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	59526	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.2660923748206
chr6	1335859	1336005	1335918	Y	NA	FOXQ1	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	25184	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	330903	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	1869270	1869328	1869296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	374598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	1966604	1966616	1966610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	277310	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	2029223	2029245	2029234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	214681	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	2980500	2980669	2980575	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NQO2	5552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	2992078	2992424	2992251	Y	NA	SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2	NA	NA	NA	NA	NQO2	5857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3072108	3072295	3072201	Y	NA	RIPK1,BPHL	NA	NA	NA	NA	RIPK1	9883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	3230738	3231042	3230747	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	1101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG4	18425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	24636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	4603647	4603982	4603794	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	100411	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	4931719	4931926	4931911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPP40	70371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	5157743	5158129	5157936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	101043	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	737155	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	737798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	6803868	6804205	6804018	Y	RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	301625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	6851413	6851674	6851488	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	254156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	7167368	7167553	7167460	Y	CAGE1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	61538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	7731119	7731407	7731310	Y	TXNDC5,TXNDC5,BMP6	NA	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	142687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	8283102	8283467	8283280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	150327	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,GCNT2	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	10589491	10589864	10589781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	99035	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	183282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	169978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr6	11357622	11357891	11357774	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	22690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11390283	11390548	11390416	Y	NEDD9	NEDD9	NEDD9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NEDD9	9702	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11414036	11414330	11414188	Y	TMEM170B,LOC221710,NEDD9	NEDD9	NEDD9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	33455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	11687957	11688294	11688126	Y	NA	NA	HIVEP1,TMEM170B,ADTRP,EDN1	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	307376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	13454706	13455038	13454979	Y	RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	15589107	15589675	15589446	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	71614	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16319874	16320274	16319989	Y	MYLIP	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	83063	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	184121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16439523	16439703	16439580	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	202712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	237382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	16481928	16482422	16482245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	245117	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	171014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16652450	16652671	16652543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	106698	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16687739	16687973	16687884	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	71396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	16729304	16729629	16729584	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	29740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	17015732	17016108	17015919	Y	FLJ23152	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	18778775	18778874	18778845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	411996	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	20174199	20174610	20174442	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	36060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	20206748	20206864	20206806	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	3806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	20239005	20239080	20239045	Y	NA	MBOAT1	MBOAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MBOAT1	28335	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	20498349	20498567	20498410	Y	MBOAT1	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	34121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	22718056	22718333	22718272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-209A6.1	311676	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	24514097	24514400	24514249	Y	NA	ALDH5A1,GPLD1	NA	NA	NA	NA	GPLD1	20664	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	24659946	24660207	24660006	Y	TDP2,C6orf62	KIAA0319,TDP2,ACOT13	NA	NA	NA	NA	TDP2	5054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	25365155	25365324	25365182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	87849	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	25458860	25459089	25458879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	181554	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	27780866	27781094	27780996	Y	ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BM	44	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30019374	30019509	30019439	Y	NA	HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	5167	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31,TRIM40	NA	NA	NA	NA	TRIM31	10038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31,TRIM40	NA	NA	NA	NA	TRIM31	8845	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	44805	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30434534	30434831	30434712	Y	DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	RANP1,HLA-E	PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANP1	16886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	30719576	30719814	30719695	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9245	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30735359	30735715	30735624	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,IER3	TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	25028	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2,SFTA2,DPCR1	NA	NA	NA	NA	DPCR1	16692	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	31240851	31241006	31240942	Y	NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B	HLA-C,RPL3P2	NA	NA	NA	NA	HLA-C	2944	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6E,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	32577297	32577935	32577770	Y	GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1	HLA-DRB1,HLA-DQA1	NA	NA	NA	NA	HLA-DQA1	16021	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	HLA-DOB,TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	32952668	32952702	32952685	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	16659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	19118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33038663	33038946	33038898	Y	HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,TAP1,PSMB9,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1	HLA-DPB1,HLA-DPA1	NA	NA	NA	NA	HLA-DPB1	2757	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33684801	33685193	33684861	Y	NA	NA	MNF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LEMD2	69720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD2	37463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr6	35026753	35026994	35026778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	171711	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	36325840	36326033	36325939	Y	CPNE5	C6orf222,RP1-50J22.4,ETV7	NA	NA	NA	NA	C6orf222	23178	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	LAP3P2	10591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	37024161	37024556	37024514	Y	NA	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	FGD2	52739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	37471092	37471543	37471443	Y	FTSJD2	NA	CCDC167,FTSJD2,MDGA1,RNF8,MIR4462,BTBD9	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF8	151344	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	NA	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF8	164545	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	40132230	40132456	40132336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-278E11.3	207658	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr6	40463742	40464103	40464095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-278E11.3	539170	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	UNC5CL	NA	NA	NA	NA	UNC5CL	39315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	41608113	41608435	41608156	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	5493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	41612844	41613289	41612975	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	10224	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	42722931	42723177	42723029	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	10373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	42735698	42735757	42735728	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	23140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	39366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	43771690	43772179	43771963	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	35769	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	43774176	43774478	43774332	Y	NA	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	38255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr6	43975133	43975197	43975165	Y	CDC5L,C6orf223	C6orf223	NA	NA	NA	NA	C6orf223	8816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	C6orf223,RP5-1120P11.3	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	27771	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44043583	44043857	44043624	Y	SLC35B2	RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	3933	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	4678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	44835345	44835718	44835412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	482083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	45317803	45318343	45317888	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	25347	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	46784396	46784595	46784543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	165718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	47382599	47382792	47382666	Y	NA	NA	CD2AP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD2AP	60733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	52505026	52505217	52505106	Y	NA	TMEM14A	EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM14A	28690	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	105020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	54714400	54714688	54714559	Y	NA	FAM83B	NA	NA	NA	NA	FAM83B	4831	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	57313567	57313842	57313733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	135964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	66497701	66498057	66497748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2153976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	69353902	69354407	69354113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	1150596	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	69557739	69558046	69557893	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	946957	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	73786085	73786476	73786271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1	231612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	76467215	76467333	76467230	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	10306	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	81197510	81197656	81197595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	383146	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	81550162	81550525	81550226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	735798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	90008898	90009057	90008978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	51510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	300093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	93036003	93036032	93036018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	1741239	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	99081727	99082103	99081968	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	311746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	99975087	99975427	99975257	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	USP45	7483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	101211686	101211775	101211752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	115473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	105012983	105013346	105013291	Y	LIN28B,HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	292448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	106537985	106538349	106538117	Y	PRDM1,PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	5790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	106643011	106643217	106643065	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	110816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.11587701537832
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	109056613	109056789	109056693	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	110830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	109059217	109059645	109059338	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	107974	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	109060413	109060511	109060471	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	107108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	109672770	109673128	109672949	Y	NA	CD164	NA	NA	NA	NA	CD164	28634	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	109755732	109756057	109756030	Y	CD164	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	SMPD2	3909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	110189562	110189879	110189721	Y	NA	NA	FIG4	IMR90	Hi-C	24141950	FIG4	179063	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	42393	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	110677101	110677173	110677119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDO	57592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	110858540	110858785	110858603	Y	NA	NA	AMD1,RPF2,GTF3C6,CDK19,SLC16A10	IMR90	Hi-C	24141950	DDO	123775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	111025527	111025575	111025551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	109586	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	111612312	111612528	111612438	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	33761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	111720734	111721265	111721077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	81449	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	112068361	112068832	112068769	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	123823	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	112097804	112098263	112098017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	94392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	112110273	112110463	112110418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	82192	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	112306517	112306577	112306547	Y	TRAF3IP2	NA	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	WISP3	66698	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	114015292	114015315	114015304	Y	NA	NA	MARCKS	MCF7	ChIA-PET	22265404	MARCKS	161226	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	114318333	114318559	114318390	Y	NA	RP3-399L15.3,HDAC2	NA	NA	NA	NA	HDAC2	11913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	117819510	117819668	117819589	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	46530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	120445667	120446036	120445852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM9	1191340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	130030425	130030727	130030721	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	1055	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	484110	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	132057565	132057807	132057687	Y	NA	RP5-988G15.1	NA	NA	NA	NA	RP5-988G15.1	42645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	133133336	133133580	133133458	Y	NA	SNORD101	NA	NA	NA	NA	RPS12	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	134701422	134701794	134701609	Y	NA	NA	ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK1	64172	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	296738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	136390405	136390550	136390494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	218439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	136912004	136912367	136912204	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	42047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	138353138	138353418	138353320	Y	PERP	NA	PERP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PERP	73230	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	138890859	138891324	138891176	Y	PBOV1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	NHSL1	120384	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	139213986	139214343	139214165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	93055	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	139852407	139852567	139852460	Y	HECA	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	158650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	139899473	139899647	139899531	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	205716	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	142290502	142290595	142290549	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	175772	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	142508557	142508921	142508635	Y	NA	VTA1	NA	NA	NA	NA	VTA1	42190	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	143919610	143919807	143919683	Y	NA	NA	PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	PHACTR2	63628	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	UTRN	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	UTRN	19137	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	144657152	144657284	144657222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	52315	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	145131744	145132215	145131879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	526907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	152887777	152887895	152887836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	69041	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	153936514	153936863	153936689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475C16.1	334646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	155181312	155181660	155181451	Y	TIAM2,TIAM2	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	128853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	155438419	155438575	155438497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	137283	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	155649228	155649931	155649893	Y	NA	TFB1M	ARID1B,MIR4466	IMR90	Hi-C	24141950	TFB1M	15601	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	157168828	157169241	157169084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	71765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr6	158515424	158515781	158515670	Y	SYNJ2,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SERAC1	71531	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	158640222	158640658	158640460	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	52838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr6	160404300	160404614	160404397	Y	SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	16169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	160699946	160700334	160700305	Y	LPA	RP1-276N6.2	NA	NA	NA	NA	RP1-276N6.2	8297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	161536644	161536718	161536688	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	125885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	48290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	166967000	166967189	166967118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	212921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	167028527	167028763	167028637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	274448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	167060808	167061200	167060975	Y	PRR18,RPS6KA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	256739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	167461087	167461406	167461193	Y	RNASET2,GPR31,CCR6	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	50417	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	167534229	167534357	167534277	Y	CCR6	CCR6	NA	NA	NA	NA	CCR6	10934	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	167688642	167688747	167688695	Y	NA	UNC93A	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	UNC93A	5985	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr6	167722257	167722471	167722311	Y	FGFR1OP,UNC93A	UNC93A	NA	NA	NA	NA	UNC93A	39600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	167724902	167725098	167724985	Y	NA	UNC93A	NA	NA	NA	NA	UNC93A	42245	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr6	168100191	168100503	168100332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	125099	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	168789584	168789819	168789635	Y	NA	NA	CCR6	IMR90	Hi-C	24141950	MLLT4	563982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	169690222	169690462	169690289	Y	NA	THBS2	NA	NA	NA	NA	THBS2	38083	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	170449336	170449548	170449442	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM120B	148243	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	FAM120B	135907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	170467648	170467815	170467737	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	129976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	129367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	8191	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	649143	649523	649193	Y	COX19	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	91210	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	964406	964697	964471	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	28346	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	965289	965600	965408	Y	ZFAND2A,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	27443	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr7	988760	989207	989097	Y	ADAP1	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	ADAP1	3836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.11587701537832
chr7	1017371	1017727	1017512	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	CYP2W1	3108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	1125303	1125884	1125584	Y	GPER,GPER	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	43091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	1140726	1141099	1140817	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	34797	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	1495047	1495214	1495102	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	1924	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr7	1965570	1966023	1965918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	185643	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	1968189	1968469	1968397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	188262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	1990940	1991132	1991045	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	211013	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2145561	2145831	2145692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	125047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	2150639	2150902	2150796	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	119976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2276986	2277172	2277058	Y	LFNG,SNX8	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	FTSJ2	2668	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	2647516	2647699	2647608	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	21886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr7	2667919	2668210	2667992	Y	NA	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	1375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	2836098	2836460	2836342	Y	SNX8,LFNG	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	36795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	4660172	4660397	4660258	Y	NA	FOXK1	SDK1,FOXK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	20991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	5379232	5379531	5379399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC18	83514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	6676235	6676334	6676285	Y	NA	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	1282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	7984284	7984579	7984481	Y	GLCCI1	NA	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	RPL23AP51	204118	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	8173918	8174349	8174085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	125514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	8175214	8175426	8175339	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	124437	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	11089099	11089199	11089149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	77600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	11499121	11499331	11499225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	487622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	12105634	12105996	12105845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	142871	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	13021746	13022072	13021909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	297265	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	13512547	13512927	13512737	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P21	596078	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	16060900	16061318	16061010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKMY2	622124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	109980	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr7	17082630	17082968	17082726	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	163019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	17084621	17084791	17084701	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	165010	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	17094571	17094955	17094779	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	174960	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	17108869	17109083	17109010	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	189258	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	17139132	17139382	17139242	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	196864	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr7	17402534	17402650	17402592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	65553	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	18551067	18551390	18551179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	426495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	18688713	18688867	18688789	Y	HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	564141	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	18695404	18695888	18695683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	570832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	20278131	20278917	20278549	Y	NA	MACC1,AC005083.1	MACC1	K562	ChIA-PET	22265404	AC005083.1	22931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	20447290	20447655	20447472	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	78965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	21260621	21260992	21260836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	204660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	24803089	24803421	24803235	Y	DFNA5,DFNA5	NA	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	215832	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	157922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	27176174	27176251	27176224	Y	HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5	HOXA-AS2,HOXA5,HOXA6,HOXA10-AS,RP1-170O19.20,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA5	5036	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	28000804	28001209	28000940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	217153	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	44573	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	29329328	29329463	29329355	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	96261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	34019230	34019836	34019529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSR1	676015	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	215061	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr7	35757759	35757862	35757813	Y	SEPT7	HERPUD2	SEPT7	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD2	24578	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36157611	36157822	36157717	Y	NA	EEPD1	EEPD1,KIAA0895	IMR90	Hi-C	24141950	EEPD1	32936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36248787	36249072	36248912	Y	EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	EEPD1	58029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36323214	36323703	36323368	Y	AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	103712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36325961	36326134	36326050	Y	AOAH,SEPT7,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	101281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36331807	36331936	36331811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	95479	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	38695355	38695603	38695479	Y	NA	NA	AMPH	IMR90	Hi-C	24141950	VPS41	274391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	43593728	43593915	43593801	Y	NA	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	26442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004453.8	68409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	NPC1L1,DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	45963987	45964294	45964096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT7P2	157370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	46839094	46839193	46839144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	780963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	47092629	47092731	47092679	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	527425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.79398979673297
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr7	47515604	47515892	47515680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104264	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	47573930	47574208	47574136	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	45948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	47610205	47610436	47610283	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	9720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	48240591	48240965	48240675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	114366	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	50332008	50332237	50332142	Y	IKZF1	NA	IKZF1	K562	ChIA-PET	22265404	FIGNL1	183851	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	DDC	NA	NA	NA	NA	DDC	35697	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	50807671	50808051	50807982	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	51108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	50937136	50937349	50937243	Y	NA	NA	COBL,DDC,GRB10	IMR90	Hi-C	24141950	GRB10	77977	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.776820624701
chr7	55198488	55198937	55198616	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	113774	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	CALM1P2	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	2993	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.32188721864535
chr7	55600079	55600443	55600389	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	38238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	55600779	55601841	55601199	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	36840	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	57577552	57577783	57577653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	69669	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	131440	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	18.6008415766524
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.41630773426287
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	70358448	70358664	70358566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	1046580	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	71695325	71695502	71695415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	290081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	71870457	71870875	71870589	Y	TYW1B	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	425902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.776820624701
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	73631936	73632436	73632119	Y	LAT2	EIF4H,LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	LAT2	19954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	73989785	73989913	73989858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	80081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL26,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	75833146	75833486	75833315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB1	96375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG	NA	NA	NA	NA	YWHAG	22825	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	76907614	76907779	76907731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	158181	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	77028776	77029116	77028943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	135476	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	77042340	77042746	77042618	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	121846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	77043308	77044194	77043379	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	120398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	77057322	77057668	77057603	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	PION,PTPN12	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPN12	106924	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	82013345	82013689	82013507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	1463670	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	84119513	84119698	84119606	Y	NA	SEMA3A	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	342	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	90236421	90236455	90236438	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN12	225386	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	92053507	92053858	92053662	Y	NA	GATAD1	GATAD1,ANKIB1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATAD1	20909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	92233387	92233691	92233548	Y	NA	FAM133B	FAM133B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	15679	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	92260832	92261202	92261012	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43124	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	92262528	92262734	92262631	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	92263416	92263696	92263624	Y	SAMD9,CDK6	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	45708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	64597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BET1	205294	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	95913909	95914253	95914081	Y	SLC25A13	SLC25A13	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	35206	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	97995155	97995543	97995349	Y	NA	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	18353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	98028342	98028618	98028511	Y	BRI3	RPS3AP26	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	98749978	98750302	98750140	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	10255	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	101586234	101586281	101586260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	129275	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	101705228	101705677	101705492	Y	SH2B2,ORAI2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	248269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	101789481	101789757	101789558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	212562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	102071349	102071499	102071491	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	54	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	RP11-325F22.2	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-325F22.2	5948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	106007567	106007812	106007694	Y	PIK3CG,FLJ36031,NAMPT	NA	CCDC71L,SYPL1,NAMPT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	82795	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	467252	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	112404343	112404501	112404446	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	24146	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf60	655881	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	115628505	115628783	115628705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TES	219764	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	116271021	116271344	116271193	Y	NA	MET	TES,CAV1,MET,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	39100	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	116332814	116332936	116332875	Y	CAPZA2,TES	MET	NA	NA	NA	NA	MET	22370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	120703433	120703512	120703470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	114630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	122072950	122073321	122073136	Y	FEZF1,CADPS2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZF1	124205	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	123410612	123410856	123410679	Y	NA	WASL	WASL	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WASL	23491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	127862070	127862227	127862161	Y	IMPDH1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	119735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.45493340605565
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	129175900	129176034	129175960	Y	NRF1	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	73521	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	65248	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	131010342	131010498	131010376	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1-AS	NA	NA	NA	NA	MKLN1-AS	483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	133769640	133769950	133769795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B4	229853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B4	117353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	138755461	138755819	138755643	Y	SVOPL,ZC3HAV1	ZC3HAV1L,ZC3HAV1	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	36646	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	138802981	138803298	138803094	Y	UBN2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZC3HAV1	10516	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	139930411	139930852	139930521	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	168890	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	139931722	139931923	139931859	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB19	169920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr7	141371952	141372250	141372100	Y	CLEC5A	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	27703	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	148269293	148269443	148269383	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	6050	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.5107282498804
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	149193399	149193541	149193458	Y	ZNF467,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF862	64189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	150705271	150705459	150705364	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,KCNH2	NOS3,ATG9B,ABCB8,SLC4A2,CDK5	NA	NA	NA	NA	ATG9B	14127	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	151384772	151384923	151384848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	169566	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	152111667	152111916	152111792	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	20064	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28363	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	153962360	153962659	153962529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	830135	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	154958521	154958650	154958585	Y	NA	NA	PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	128836	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.03862567179277
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	157082402	157082699	157082633	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	157809172	157809538	157809355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	568942	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	157924006	157924393	157924072	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	454087	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	152481	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr7	158378369	158378681	158378482	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.30471804661337
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	1762268	1762565	1762495	Y	KBTBD11,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	51600	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	498785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	4848301	4848393	4848346	Y	CSMD1	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	205447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115C21.2	60433	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	13438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	6417141	6417596	6417436	Y	ANGPT2	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	ANGPT2	1334	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	8142177	8142516	8142347	Y	NA	ALG1L13P	SGK223,CLDN23,MFHAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ALG1L13P	41988	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG1L13P	53408	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.96566165593605
chr8	8701542	8701893	8701762	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	47262	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.07725134358555
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	10267879	10268236	10267884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	358101	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr8	11558749	11558994	11558836	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	26281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	12894442	12894833	12894561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	282860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	16456679	16456744	16456714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37A	645336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	17583613	17583759	17583634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	73095	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	18704322	18704730	18704574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	235510	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	18985501	18986149	18985818	Y	NA	PSD3	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	45261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	18991999	18992391	18992140	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	51759	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	58017	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	19236420	19236600	19236592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	67292	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	73475	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	22410101	22410594	22410364	Y	EPB49,LGI3,PHYHIP,RHOBTB2,RHOBTB2,EGR3,EGR3,SORBS3	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	SORBS3	9602	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	22441359	22441704	22441532	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	7567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	27182	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	36382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	22626037	22626421	22626168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BIN3	101376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	24152439	24152589	24152514	Y	ADAM28	ADAM28	NA	NA	NA	NA	ADAM28	2886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	25133664	25134104	25133793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	93426	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EBF2	108016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	26904568	26904899	26904734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM35	261937	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29028606	29028803	29028712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13B	89838	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	29213594	29213602	29213597	Y	NA	DUSP4	DUSP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP4	7409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29230223	29230556	29230411	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29352535	29352969	29352683	Y	DUSP4	NA	LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	146350	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29495067	29495424	29495202	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	288882	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	7.74248228063704
chr8	29561597	29561859	29561693	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP4	355412	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29914930	29915195	29915084	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM66	23528	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29948448	29949236	29948548	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	1678	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	29957112	29957836	29957408	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	6198	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	30358644	30358942	30358767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	117727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	33743518	33743769	33743644	Y	MAK16	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	27777	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	37404927	37405081	37405004	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1,ZNF703	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	4620	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	37889292	37889604	37889448	Y	NA	EIF4EBP1	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP1	3433	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	38791407	38791790	38791499	Y	NA	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	34654	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	38816649	38817007	38816807	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	TM2D2	35336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	39918999	39919284	39919148	Y	C8orf4	NA	C8orf4,ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	89705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	39976615	39976841	39976744	Y	IDO1	C8orf4	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	32148	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	41153046	41153278	41153162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD65	128896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	42356471	42356680	42356560	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	38389	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr8	49175738	49176128	49175933	Y	NA	NA	SNAI2,MCM4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	119022	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	54256811	54256964	54256882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-162D9.3	168680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	56891091	56891632	56891326	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	92828	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	56919174	56919348	56919316	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	65112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	302281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	67566708	67566914	67566811	Y	NA	MYBL1,VCPIP1,C8orf44	NA	NA	NA	NA	VCPIP1	10538	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	17495	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	71106642	71106934	71106707	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	92228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	NA	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1145L24.1	783542	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	77128503	77128819	77128661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	782461	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	NA	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS28	234269	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.8884103123505
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	239297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	82217003	82217352	82217179	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	NA	NA	NA	NA	RP11-363E6.3	25322	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	87404027	87404214	87404101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	51060	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	94947484	94947898	94947643	Y	GEM	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	79449	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	95943173	95943450	95943312	Y	NA	CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3	NA	NA	NA	NA	TP53INP1	16189	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	97171094	97171453	97171221	Y	GDF6	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	74409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	99526737	99526942	99526761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	222116	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	103933096	103933543	103933196	Y	NA	AZIN1	AZIN1,ATP6V1C1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AZIN1	29004	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	107770186	107770567	107770447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	61945	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	109032170	109032316	109032309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	413246	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	110564309	110564669	110564608	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	14369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	110589431	110589605	110589518	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	39491	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	112279514	112279729	112279622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	1577494	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	117883999	117884137	117884073	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	MIR3610	902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr8	119419771	119420080	119419851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	212154	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	121628287	121628559	121628462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	172645	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	121839869	121840146	121840008	Y	NA	SNTB1	SNTB1	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	16356	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	304196	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	122755244	122755615	122755430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	103614	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	125341304	125341312	125341308	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	41621	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	125616678	125616991	125616828	Y	ZNF572	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	66979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	14.1630773426287
chr8	125640439	125640642	125640477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	90740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	125642565	125642695	125642641	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	92866	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126399072	126399443	126399281	Y	NA	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	41120	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	126525260	126525748	126525427	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	84697	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr8	127387635	127388005	127387836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	180115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	127928770	127929133	127928805	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	300200	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	158704	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	129791	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	128167127	128167527	128167484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	61806	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46544	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.17167185920307
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	128231853	128232218	128232163	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	2520	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128237300	128237732	128237515	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	7967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128305149	128305567	128305521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	75816	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.69956928111545
chr8	128311072	128311242	128311156	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	81739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	128888912	128889201	128889088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	84133	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	115052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	198130	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	232202	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	242687	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	271530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PVT1	384046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	130549230	130549454	130549342	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	477921	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131012344	131012436	131012358	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	14939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131027030	131027189	131027125	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	186	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131232940	131233341	131233190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	205565	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131260848	131261137	131260957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	233473	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	327107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	133508104	133508400	133508366	Y	NA	NA	KCNQ3,LRRC6	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM71	262558	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	134137662	134137980	134137772	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	174285	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	134699077	134699376	134699146	Y	NA	NA	ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	116894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	136314208	136314428	136314340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	153272	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	137225928	137226328	137226138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	758228	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	137248395	137248553	137248474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	780695	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	139799567	139799714	139799659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	913585	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	141361313	141361457	141361385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	105221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	141454964	141454973	141454969	Y	NA	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	11705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.3991385622309
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	142289630	142289814	142289772	Y	NA	SLC45A4	SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	26590	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	142591617	142591932	142591762	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P38	124442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,LYPD2	NA	NA	NA	NA	LYPD2	22024	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr8	143837804	143838151	143837954	Y	NA	LYPD2,LY6D	NA	NA	NA	NA	LYPD2	5852	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	144300737	144301128	144300944	Y	GPIHBP1	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	26152	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr8	144611629	144611857	144611767	Y	ZC3H3	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1	RHPN1,C8orf51	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H3	9766	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr8	146085419	146085616	146085518	Y	NA	ZNF7,COMMD5,ZNF250	NA	NA	NA	NA	COMMD5	8298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	2490043	2490145	2490094	Y	NA	NA	KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0020	352096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	186436	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	3863148	3863487	3863216	Y	NA	GLIS3-AS1	NA	NA	NA	NA	GLIS3-AS1	33155	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4296901	4297617	4297146	Y	GLIS3	GLIS3	NA	NA	NA	NA	GLIS3	48775	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4334414	4334840	4334611	Y	NA	GLIS3	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	11552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4544914	4545090	4545003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	56470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	4715214	4715412	4715290	Y	AK3	CDC37L1,AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	24631	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4855592	4855625	4855609	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	7301	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	4992033	4992419	4992226	Y	NA	JAK2	NA	NA	NA	NA	JAK2	9000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	5893266	5893397	5893330	Y	MLANA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	62149	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	5901129	5901190	5901160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	70012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	7656703	7657015	7656841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	180383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	9912233	9912588	9912411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	823357	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	11018357	11018684	11018521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1793660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	6.89269764007932
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	6299	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr9	14427879	14427964	14427922	Y	NFIB	NFIB	LURAP1L,NFIB,MPDZ,FLJ41200	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	30897	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	16025511	16025884	16025698	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93,CNTLN	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	499830	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	16681430	16681562	16681496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P12	1155749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	20784777	20784885	20784831	Y	IFNW1	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	164235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL9	236740	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	21388342	21388353	21388348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL9	54963	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103429	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	21809706	21810111	21809856	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	9164	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	21817235	21817446	21817291	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	16693	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	27117778	27117984	27117879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAA	172317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	32183281	32183478	32183392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	199140	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	32429787	32430147	32430005	Y	NA	ACO1	NA	NA	NA	NA	ACO1	47169	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	33158582	33158891	33158872	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	6463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr9	33350411	33350624	33350531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFX1	61902	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	34179799	34180083	34180009	Y	UBE2R2,UBAP1	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	2796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	35153448	35153469	35153459	Y	NA	FAM214B,UNC13B	UNC13B,ATP8B5P	IMR90	Hi-C	24141950	UNC13B	6530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	110762	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,SIT1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr9	36164977	36165259	36165107	Y	NA	CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	23594	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	CLTA	42694	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	41948	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	37925048	37925073	37925061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	125614	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	37945283	37945292	37945288	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	121392	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1B1	46909	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1997612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80021	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	71734977	71735184	71735061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	86802	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	145235	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	147381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	73178748	73179070	73178790	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	151208	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	75791521	75791823	75791639	Y	NA	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	26848	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	75848959	75849147	75849065	Y	ANXA1	NA	RORB	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	84286	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	78507446	78507579	78507560	Y	PCSK5	PCSK5	NA	NA	NA	NA	PCSK5	3886	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	84915619	84915749	84915684	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD95	413786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	85587803	85587810	85587807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	88282	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	87326939	87327108	87327024	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	373267	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	416705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	87470234	87470516	87470442	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	516562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	88286391	88286647	88286519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	68297	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	88588670	88588806	88588674	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	34609	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	88983987	88984393	88984184	Y	NA	ZCCHC6	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC6	16618	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	90182587	90182864	90182726	Y	NA	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	44370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	90226779	90227017	90226862	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	88562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr9	92057511	92057673	92057630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	53372	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chr9	93880356	93880696	93880620	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	241499	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	93893646	93894080	93893930	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	228115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	93910029	93910270	93910112	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	LOC100129316,AUH,NFIL3	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	211925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr9	93960145	93960482	93960197	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	161713	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	95288173	95288480	95288343	Y	NA	RP11-19J3.5	NA	NA	NA	NA	RP11-19J3.5	10986	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	95716430	95716630	95716571	Y	SUSD3,FAM120AOS,FGD3	FGD3	NA	NA	NA	NA	FGD3	8697	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	96845736	96845997	96845867	Y	NA	CYCSP24	NA	NA	NA	NA	CYCSP24	47424	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr9	97672080	97672130	97672087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	185097	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	97699905	97700054	97699963	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	212922	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	97966859	97967268	97967183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	110723	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	98389369	98389482	98389428	Y	NA	NA	LOC158434	IMR90	Hi-C	24141950	PTCH1	112030	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	98772080	98772357	98772164	Y	C9orf102	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	133932	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	99322452	99322838	99322645	Y	ZNF782	NA	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	57274	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.1330461874103
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	14046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	101572840	101572995	101572898	Y	GALNT12	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	4859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	101573359	101573810	101573605	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	5378	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	102195698	102196356	102196027	Y	TGFBR1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	213352	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABCA1	66894	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	107983498	107983520	107983511	Y	NA	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	21383	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chr9	110819751	110819910	110819831	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	525080	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	111003656	111003963	111003923	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	383150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	111025609	111025952	111025781	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	361161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	112076384	112076614	112076499	Y	NA	EPB41L4B	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	4630	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	112173287	112173639	112173503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN3	84951	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	112238648	112239006	112238827	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	19584	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	112937115	112937268	112937191	Y	NA	C9orf152	NA	NA	NA	NA	C9orf152	31201	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG10	84016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	115887766	115888107	115887986	Y	SNX30,RGS3,SLC31A2	SLC31A2	SLC31A2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC31A2	23115	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr9	116304651	116305008	116304842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	133699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	117040965	117041219	117041139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	125125	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	117080236	117080340	117080297	Y	TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1	NA	NA	NA	NA	NA	COL27A1	164396	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	188000	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	230947	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.45493340605565
chr9	117657108	117657611	117657338	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	220925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556397	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	120481913	120482131	120481990	Y	TLR4	TLR4	NA	NA	NA	NA	TLR4	17303	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	121918529	121918824	121918789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1421624	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	122678487	122678506	122678497	Y	NA	NA	DBC1,SKAP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323	CDK5RAP2	661942	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	123652168	123652528	123652495	Y	NA	PSMD5,PHF19	PHF19	IMR90	Hi-C	24141950	PHF19	14562	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	12.7467696083659
chr9	125869246	125869355	125869301	Y	OR1L3,OR1K1,GPR21	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	159500	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	126690123	126690365	126690192	Y	DENND1A	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	66	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	126695812	126695993	126695905	Y	PSMB7	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	5381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	126895140	126895472	126895256	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	122413	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	127837483	127837706	127837595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAI	66079	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	8.02574382748962
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	129929259	129929425	129929350	Y	LRSAM1,RALGPS1	NA	NA	NA	NA	NA	GARNL3	55119	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	MIR3911,C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	23893	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130717134	130717317	130717253	Y	NA	ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	18371	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130718218	130718307	130718248	Y	NA	ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	DPM2	19455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130731999	130732057	130732026	Y	SLC25A25,DPM2,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	8735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	130753520	130753846	130753692	Y	SLC25A25,DPM2,FAM102A	FAM102A	FAM102A	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM102A	12728	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130898933	130899188	130899061	Y	FAM102A	PTGES2,LCN2,C9orf16	NA	NA	NA	NA	LCN2	10162	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	130907941	130908020	130907981	Y	SLC27A4,PIP5KL1,PTGES2	PTGES2,LCN2,C9orf16	NA	NA	NA	NA	LCN2	1330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	131929021	131929365	131929193	Y	NA	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	9175	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	132124421	132124717	132124470	Y	NA	C9orf106,RP11-65J3.1	LOC100506190,PHYHD1,SH3GLB2,DOLPP1,CRAT,PPP2R4,IER5L,C9orf50	MCF7,HELA,K562,GM12878,H1ESC,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	31842	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	132171147	132171349	132171255	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	72381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chr9	132220495	132220692	132220545	Y	FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6	LINC00963	PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	23038	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	132321078	132321454	132321255	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	77348	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132598761	132599163	132598839	Y	NA	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	C9orf78	2619	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132793561	132793711	132793627	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	19994	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	132835796	132835981	132835917	Y	TOR1B,FNBP1	GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	22091	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	ABL1	148912	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr9	134278219	134278688	134278276	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	10739	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	134603973	134604163	134604103	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	9298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	134770006	134770262	134770128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	156545	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	135248049	135248343	135248270	Y	SETX	SETX,TTF1	NA	NA	NA	NA	SETX	19677	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	135994562	135994927	135994701	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	42374	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	135995063	135995322	135995085	Y	RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	41979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	136008698	136009031	136008833	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	28270	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	136800116	136800268	136800192	Y	C9orf7	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	55458	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	136820460	136820750	136820516	Y	SARDH	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	34976	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	137219951	137220008	137219980	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13007	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	511318	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr9	137739401	137739789	137739783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	532457	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr9	138370318	138370583	138370451	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	1393	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	138852334	138852387	138852361	Y	CARD9	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	1108	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	139427023	139427107	139427058	Y	NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	11207	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	139433298	139433437	139433354	Y	ABCA2,CARD9,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	4877	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	AGPAT2,SNHG7,LCN10	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	139595835	139596071	139595988	Y	SEC16A,LCNL1,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2	AGPAT2,SNHG7,LCN10	SNORA43,SNHG7	MCF7	ChIA-PET	22265404	AGPAT2	15960	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,LCN12,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	13.4077132176885
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	2.36051289043812
chr9	140169154	140169348	140169240	Y	NA	TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	25355	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	7.45922073378447
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	140221048	140221451	140221248	Y	UAP1L1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	26345	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chr9	140301767	140302162	140302062	Y	NA	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	13552	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.755364124940199
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	54216	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	3591324	3591658	3591618	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	37991	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.849784640557724
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	110747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	10134579	10135018	10134856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	349070	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	263365	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	11158305	11158560	11158458	Y	ARHGAP6	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	30884	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	11843387	11843764	11843576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	69109	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	12969061	12969258	12969197	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21969	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	12996273	12996492	12996427	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5046	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	13711501	13711681	13711616	Y	ATXN3L,RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	6257	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	15469517	15469528	15469523	Y	NA	PIR	NA	NA	NA	NA	PIR	40159	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	15871584	15871957	15871763	Y	CA5B,ZRSR2,AP1S2	AP1S2	ZRSR2	K562	ChIA-PET	22265404	AP1S2	530	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	18445170	18445478	18445437	Y	NA	CDKL5	NA	NA	NA	NA	CDKL5	3467	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	18488966	18489254	18489110	Y	NA	CDKL5	NA	NA	NA	NA	CDKL5	47263	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	20281516	20281702	20281609	Y	SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3	RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	1821	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	22007452	22007864	22007637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	50761	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	22253958	22253963	22253961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	297267	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	22708356	22708573	22708502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX53	307514	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	22914204	22914355	22914279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX53	101732	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	311856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	23817688	23817829	23817775	Y	NA	ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1	NA	NA	NA	NA	SAT1	18398	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX	NA	NA	NA	NA	ZFX	22415	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	28961310	28961674	28961353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-12D5.5	1081300	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	29699916	29700254	29699978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	946161	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	30646047	30646125	30646067	Y	GK,CXorf21	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	290	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	30675885	30676221	30676093	Y	CXorf21,GK	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	GK	6409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	30717069	30717144	30717107	Y	CXorf21,GK	GK	NA	NA	NA	NA	GK	47593	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	36981340	36981727	36981708	Y	PRRG1,PRRG1	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG1	224801	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	37613614	37613928	37613771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XK	70602	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	37614393	37614669	37614509	Y	CYBB	NA	NA	NA	NA	NA	XK	71381	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	39490684	39490840	39490763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	154550	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	39953251	39953461	39953335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	81121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	39963356	39963613	39963579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70969	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.472102578087625
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chrX	40726668	40726852	40726751	Y	ATP6AP2,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	38385	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	41190836	41191010	41190932	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	185	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	44834978	44835378	44835063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	104221	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	44877456	44877597	44877527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	146699	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	45617544	45618196	45618069	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13014	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	45667037	45667329	45667199	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	45767495	45767762	45767629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	58575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	46338861	46339028	46338937	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	40712	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	47438054	47438403	47438273	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1309	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	47492098	47492440	47492261	Y	ARAF,CFP,CFP	SYN1,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	SYN1	14846	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	48794332	48794681	48794452	Y	PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18967	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	53292881	53293274	53292937	Y	NA	KDM5C	NA	NA	NA	NA	KDM5C	40277	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.56652309370515
chrX	54207583	54207867	54207725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120C	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	110745	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	57490949	57491197	57490977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	125072	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.660943609322674
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	95940743	95941133	95941025	Y	DIAPH2	DIAPH2	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	3081	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	105809036	105809195	105809116	Y	NA	CXorf57	NA	NA	NA	NA	CXorf57	43965	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.944205156175249
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	36904	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	118149361	118149839	118149621	Y	LONRF3	LONRF3	NA	NA	NA	NA	LONRF3	42780	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	118822065	118822226	118822146	Y	NKRF,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	3107	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	119076607	119076872	119076702	Y	NKRF	NKAP	NA	NA	NA	NA	NKAP	872	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.60514876549792
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	123351438	123351580	123351505	Y	SH2D1A	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	259376	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	123735078	123735231	123735154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	643016	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	3.68240010908347
chrX	128911334	128911515	128911430	Y	ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC9	64370	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.283261546852575
chrX	129226171	129226435	129226352	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	16256	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	131625337	131625543	131625484	Y	MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	3341	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	132323332	132323559	132323446	Y	HS6ST2,USP26,GPC4	NA	NA	NA	NA	NA	GPC4	223959	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.18884103123505
chrX	138295647	138295844	138295757	Y	NA	NA	FGF13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP11C	729591	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	1.22746670302782
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	152066086	152066201	152066144	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	68575	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	152980497	152980777	152980637	Y	NA	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	BCAP31	7375	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SSR4,IDH3G,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	CYCSP45	20096	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrX	154055956	154056155	154056029	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,F8A2,F8A1,LOC100132963	NA	NA	NA	NA	NA	DKC1	66925	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrY	13470203	13470486	13470410	Y	NA	DUX4L17	NA	NA	NA	NA	DUX4L17	1606	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.3776820624701
chrY	13479190	13479567	13479379	Y	NA	DUX4L17	NA	NA	NA	NA	DUX4L17	10593	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUX4L17	1738747	CAGE	Kato III	hg19	FANTOM5	0.0944205156175249